Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Ckap2lQ7TS74 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ckap2lQ7TS74 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ckap2lQ7TS74 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ckap2lQ7TS74 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ckap2lQ7TS74 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ckap2lQ7TS74 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Ckap2lQ7TS74 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ckap2lQ7TS74 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ckap2lQ7TS74 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ckap2lQ7TS74 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ckap2lQ7TS74 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ckap2lQ7TS74 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ckap2lQ7TS74 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ckap2lQ7TS74 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ckap2lQ7TS74 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ckap2lQ7TS74 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ckap2lQ7TS74 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ckap2lQ7TS74 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ckap2lQ7TS74 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ckap2lQ7TS74 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ckap2lQ7TS74 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ckap2lQ7TS74 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ckap2lQ7TS74 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ckap2lQ7TS74 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ckap2lQ7TS74 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ckap2lQ7TS74 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ckap2lQ7TS74 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ckap2lQ7TS74 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ckap2lQ7TS74 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ckap2lQ7TS74 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ckap2lQ7TS74 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ckap2lQ7TS74 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ckap2lQ7TS74 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ckap2lQ7TS74 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ckap2lQ7TS74 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ckap2lQ7TS74 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ckap2lQ7TS74 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ckap2lQ7TS74 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ckap2lQ7TS74 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ckap2lQ7TS74 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ckap2lQ7TS74 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ckap2lQ7TS74 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Ckap2lQ7TS74 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ckap2lQ7TS74 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ckap2lQ7TS74 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ckap2lQ7TS74 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ckap2lQ7TS74 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ckap2lQ7TS74 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ckap2lQ7TS74 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ckap2lQ7TS74 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ckap2lQ7TS74 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ckap2lQ7TS74 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ckap2lQ7TS74 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ckap2lQ7TS74 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ckap2lQ7TS74 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ckap2lQ7TS74 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ckap2lQ7TS74 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ckap2lQ7TS74 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ckap2lQ7TS74 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ckap2lQ7TS74 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ckap2lQ7TS74 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ckap2lQ7TS74 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ckap2lQ7TS74 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ckap2lQ7TS74 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ckap2lQ7TS74 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ckap2lQ7TS74 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ckap2lQ7TS74 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ckap2lQ7TS74 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ckap2lQ7TS74 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ckap2lQ7TS74 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ckap2lQ7TS74 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ckap2lQ7TS74 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ckap2lQ7TS74 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Ckap2lQ7TS74 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ckap2lQ7TS74 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ckap2lQ7TS74 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ckap2lQ7TS74 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ckap2lQ7TS74 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ckap2lQ7TS74 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ckap2lQ7TS74 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ckap2lQ7TS74 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ckap2lQ7TS74 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Ckap2lQ7TS74 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ckap2lQ7TS74 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ckap2lQ7TS74 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ckap2lQ7TS74 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ckap2lQ7TS74 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Ckap2lQ7TS74 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ckap2lQ7TS74 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ckap2lQ7TS74 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ckap2lQ7TS74 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ckap2lQ7TS74 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ckap2lQ7TS74 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ckap2lQ7TS74 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ckap2lQ7TS74 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ckap2lQ7TS74 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ckap2lQ7TS74 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ckap2lQ7TS74 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ckap2lQ7TS74 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms