Protein–RNA interactions for Protein: Q7TND5

Rpf1, Ribosome production factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpf1Q7TND5 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpf1Q7TND5 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpf1Q7TND5 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpf1Q7TND5 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpf1Q7TND5 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpf1Q7TND5 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpf1Q7TND5 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpf1Q7TND5 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpf1Q7TND5 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpf1Q7TND5 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpf1Q7TND5 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpf1Q7TND5 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpf1Q7TND5 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpf1Q7TND5 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpf1Q7TND5 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpf1Q7TND5 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rpf1Q7TND5 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpf1Q7TND5 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpf1Q7TND5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpf1Q7TND5 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpf1Q7TND5 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpf1Q7TND5 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpf1Q7TND5 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpf1Q7TND5 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpf1Q7TND5 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpf1Q7TND5 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpf1Q7TND5 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpf1Q7TND5 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpf1Q7TND5 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpf1Q7TND5 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpf1Q7TND5 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpf1Q7TND5 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpf1Q7TND5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpf1Q7TND5 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpf1Q7TND5 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpf1Q7TND5 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpf1Q7TND5 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpf1Q7TND5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Rpf1Q7TND5 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpf1Q7TND5 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpf1Q7TND5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpf1Q7TND5 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpf1Q7TND5 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpf1Q7TND5 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpf1Q7TND5 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpf1Q7TND5 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpf1Q7TND5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpf1Q7TND5 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpf1Q7TND5 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpf1Q7TND5 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpf1Q7TND5 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpf1Q7TND5 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpf1Q7TND5 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpf1Q7TND5 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rpf1Q7TND5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpf1Q7TND5 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpf1Q7TND5 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpf1Q7TND5 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpf1Q7TND5 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpf1Q7TND5 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpf1Q7TND5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpf1Q7TND5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rpf1Q7TND5 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpf1Q7TND5 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpf1Q7TND5 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpf1Q7TND5 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpf1Q7TND5 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpf1Q7TND5 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpf1Q7TND5 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpf1Q7TND5 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpf1Q7TND5 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpf1Q7TND5 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpf1Q7TND5 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpf1Q7TND5 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rpf1Q7TND5 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpf1Q7TND5 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpf1Q7TND5 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpf1Q7TND5 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpf1Q7TND5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpf1Q7TND5 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpf1Q7TND5 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpf1Q7TND5 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpf1Q7TND5 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpf1Q7TND5 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpf1Q7TND5 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpf1Q7TND5 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpf1Q7TND5 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpf1Q7TND5 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpf1Q7TND5 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rpf1Q7TND5 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpf1Q7TND5 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpf1Q7TND5 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpf1Q7TND5 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpf1Q7TND5 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpf1Q7TND5 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpf1Q7TND5 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpf1Q7TND5 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpf1Q7TND5 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpf1Q7TND5 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Rpf1Q7TND5 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms