Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPT1

Klhl9, Kelch-like protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl9Q6ZPT1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Klhl9Q6ZPT1 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klhl9Q6ZPT1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klhl9Q6ZPT1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Klhl9Q6ZPT1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klhl9Q6ZPT1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klhl9Q6ZPT1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Klhl9Q6ZPT1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klhl9Q6ZPT1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klhl9Q6ZPT1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Klhl9Q6ZPT1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Klhl9Q6ZPT1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klhl9Q6ZPT1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klhl9Q6ZPT1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klhl9Q6ZPT1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klhl9Q6ZPT1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klhl9Q6ZPT1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klhl9Q6ZPT1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klhl9Q6ZPT1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klhl9Q6ZPT1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Klhl9Q6ZPT1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klhl9Q6ZPT1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klhl9Q6ZPT1 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klhl9Q6ZPT1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klhl9Q6ZPT1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klhl9Q6ZPT1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klhl9Q6ZPT1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klhl9Q6ZPT1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klhl9Q6ZPT1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Klhl9Q6ZPT1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klhl9Q6ZPT1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klhl9Q6ZPT1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klhl9Q6ZPT1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klhl9Q6ZPT1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klhl9Q6ZPT1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klhl9Q6ZPT1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klhl9Q6ZPT1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klhl9Q6ZPT1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klhl9Q6ZPT1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klhl9Q6ZPT1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Klhl9Q6ZPT1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klhl9Q6ZPT1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klhl9Q6ZPT1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klhl9Q6ZPT1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klhl9Q6ZPT1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klhl9Q6ZPT1 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klhl9Q6ZPT1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klhl9Q6ZPT1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klhl9Q6ZPT1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klhl9Q6ZPT1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klhl9Q6ZPT1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klhl9Q6ZPT1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Klhl9Q6ZPT1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klhl9Q6ZPT1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Klhl9Q6ZPT1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klhl9Q6ZPT1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klhl9Q6ZPT1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klhl9Q6ZPT1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klhl9Q6ZPT1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Klhl9Q6ZPT1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klhl9Q6ZPT1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klhl9Q6ZPT1 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klhl9Q6ZPT1 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klhl9Q6ZPT1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klhl9Q6ZPT1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Klhl9Q6ZPT1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Klhl9Q6ZPT1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Klhl9Q6ZPT1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Klhl9Q6ZPT1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Klhl9Q6ZPT1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Klhl9Q6ZPT1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Klhl9Q6ZPT1 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Klhl9Q6ZPT1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Klhl9Q6ZPT1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Klhl9Q6ZPT1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Klhl9Q6ZPT1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Klhl9Q6ZPT1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Klhl9Q6ZPT1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Klhl9Q6ZPT1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Klhl9Q6ZPT1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Klhl9Q6ZPT1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Klhl9Q6ZPT1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Klhl9Q6ZPT1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Klhl9Q6ZPT1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Klhl9Q6ZPT1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Klhl9Q6ZPT1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Klhl9Q6ZPT1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Klhl9Q6ZPT1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Klhl9Q6ZPT1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klhl9Q6ZPT1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klhl9Q6ZPT1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klhl9Q6ZPT1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klhl9Q6ZPT1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klhl9Q6ZPT1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klhl9Q6ZPT1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klhl9Q6ZPT1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klhl9Q6ZPT1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klhl9Q6ZPT1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klhl9Q6ZPT1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Klhl9Q6ZPT1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms