Protein–RNA interactions for Protein: Q6W8Q3

Pcp4l1, Purkinje cell protein 4-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcp4l1Q6W8Q3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Pcp4l1Q6W8Q3 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcp4l1Q6W8Q3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcp4l1Q6W8Q3 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcp4l1Q6W8Q3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcp4l1Q6W8Q3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcp4l1Q6W8Q3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcp4l1Q6W8Q3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcp4l1Q6W8Q3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcp4l1Q6W8Q3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pcp4l1Q6W8Q3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Pcp4l1Q6W8Q3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Pcp4l1Q6W8Q3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcp4l1Q6W8Q3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcp4l1Q6W8Q3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcp4l1Q6W8Q3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcp4l1Q6W8Q3 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcp4l1Q6W8Q3 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcp4l1Q6W8Q3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcp4l1Q6W8Q3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcp4l1Q6W8Q3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcp4l1Q6W8Q3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcp4l1Q6W8Q3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcp4l1Q6W8Q3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pcp4l1Q6W8Q3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Pcp4l1Q6W8Q3 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcp4l1Q6W8Q3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcp4l1Q6W8Q3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcp4l1Q6W8Q3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcp4l1Q6W8Q3 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcp4l1Q6W8Q3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcp4l1Q6W8Q3 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Pcp4l1Q6W8Q3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcp4l1Q6W8Q3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Pcp4l1Q6W8Q3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcp4l1Q6W8Q3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcp4l1Q6W8Q3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcp4l1Q6W8Q3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcp4l1Q6W8Q3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcp4l1Q6W8Q3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcp4l1Q6W8Q3 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pcp4l1Q6W8Q3 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Pcp4l1Q6W8Q3 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
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Pcp4l1Q6W8Q3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Pcp4l1Q6W8Q3 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcp4l1Q6W8Q3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcp4l1Q6W8Q3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcp4l1Q6W8Q3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcp4l1Q6W8Q3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcp4l1Q6W8Q3 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcp4l1Q6W8Q3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcp4l1Q6W8Q3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcp4l1Q6W8Q3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcp4l1Q6W8Q3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcp4l1Q6W8Q3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcp4l1Q6W8Q3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcp4l1Q6W8Q3 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcp4l1Q6W8Q3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcp4l1Q6W8Q3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcp4l1Q6W8Q3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pcp4l1Q6W8Q3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcp4l1Q6W8Q3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcp4l1Q6W8Q3 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcp4l1Q6W8Q3 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcp4l1Q6W8Q3 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcp4l1Q6W8Q3 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcp4l1Q6W8Q3 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcp4l1Q6W8Q3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcp4l1Q6W8Q3 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcp4l1Q6W8Q3 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcp4l1Q6W8Q3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pcp4l1Q6W8Q3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Pcp4l1Q6W8Q3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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