Protein–RNA interactions for Protein: Q6W5C0

Cxcl3, C-X-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl3Q6W5C0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cxcl3Q6W5C0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cxcl3Q6W5C0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cxcl3Q6W5C0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cxcl3Q6W5C0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cxcl3Q6W5C0 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cxcl3Q6W5C0 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cxcl3Q6W5C0 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cxcl3Q6W5C0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cxcl3Q6W5C0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cxcl3Q6W5C0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cxcl3Q6W5C0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cxcl3Q6W5C0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cxcl3Q6W5C0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cxcl3Q6W5C0 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cxcl3Q6W5C0 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cxcl3Q6W5C0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cxcl3Q6W5C0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cxcl3Q6W5C0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cxcl3Q6W5C0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cxcl3Q6W5C0 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cxcl3Q6W5C0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cxcl3Q6W5C0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cxcl3Q6W5C0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cxcl3Q6W5C0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cxcl3Q6W5C0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cxcl3Q6W5C0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cxcl3Q6W5C0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cxcl3Q6W5C0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cxcl3Q6W5C0 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cxcl3Q6W5C0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cxcl3Q6W5C0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cxcl3Q6W5C0 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cxcl3Q6W5C0 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cxcl3Q6W5C0 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cxcl3Q6W5C0 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cxcl3Q6W5C0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cxcl3Q6W5C0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cxcl3Q6W5C0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cxcl3Q6W5C0 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cxcl3Q6W5C0 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cxcl3Q6W5C0 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cxcl3Q6W5C0 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cxcl3Q6W5C0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cxcl3Q6W5C0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cxcl3Q6W5C0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cxcl3Q6W5C0 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cxcl3Q6W5C0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cxcl3Q6W5C0 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cxcl3Q6W5C0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cxcl3Q6W5C0 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cxcl3Q6W5C0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cxcl3Q6W5C0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cxcl3Q6W5C0 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cxcl3Q6W5C0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cxcl3Q6W5C0 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cxcl3Q6W5C0 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cxcl3Q6W5C0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cxcl3Q6W5C0 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cxcl3Q6W5C0 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cxcl3Q6W5C0 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cxcl3Q6W5C0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cxcl3Q6W5C0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cxcl3Q6W5C0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cxcl3Q6W5C0 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cxcl3Q6W5C0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cxcl3Q6W5C0 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Cxcl3Q6W5C0 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cxcl3Q6W5C0 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Cxcl3Q6W5C0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cxcl3Q6W5C0 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cxcl3Q6W5C0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cxcl3Q6W5C0 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cxcl3Q6W5C0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cxcl3Q6W5C0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cxcl3Q6W5C0 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cxcl3Q6W5C0 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cxcl3Q6W5C0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cxcl3Q6W5C0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cxcl3Q6W5C0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cxcl3Q6W5C0 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cxcl3Q6W5C0 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cxcl3Q6W5C0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cxcl3Q6W5C0 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cxcl3Q6W5C0 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cxcl3Q6W5C0 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cxcl3Q6W5C0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cxcl3Q6W5C0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cxcl3Q6W5C0 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cxcl3Q6W5C0 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cxcl3Q6W5C0 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cxcl3Q6W5C0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cxcl3Q6W5C0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cxcl3Q6W5C0 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cxcl3Q6W5C0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cxcl3Q6W5C0 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Cxcl3Q6W5C0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cxcl3Q6W5C0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cxcl3Q6W5C0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cxcl3Q6W5C0 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms