Protein–RNA interactions for Protein: Q6VUP9

Tfap2e, Transcription factor AP-2-epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2eQ6VUP9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tfap2eQ6VUP9 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tfap2eQ6VUP9 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tfap2eQ6VUP9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tfap2eQ6VUP9 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tfap2eQ6VUP9 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tfap2eQ6VUP9 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tfap2eQ6VUP9 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tfap2eQ6VUP9 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tfap2eQ6VUP9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tfap2eQ6VUP9 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tfap2eQ6VUP9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tfap2eQ6VUP9 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tfap2eQ6VUP9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tfap2eQ6VUP9 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tfap2eQ6VUP9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tfap2eQ6VUP9 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tfap2eQ6VUP9 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tfap2eQ6VUP9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tfap2eQ6VUP9 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tfap2eQ6VUP9 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tfap2eQ6VUP9 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tfap2eQ6VUP9 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tfap2eQ6VUP9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Tfap2eQ6VUP9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tfap2eQ6VUP9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tfap2eQ6VUP9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tfap2eQ6VUP9 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tfap2eQ6VUP9 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tfap2eQ6VUP9 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tfap2eQ6VUP9 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tfap2eQ6VUP9 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tfap2eQ6VUP9 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tfap2eQ6VUP9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tfap2eQ6VUP9 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tfap2eQ6VUP9 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tfap2eQ6VUP9 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tfap2eQ6VUP9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tfap2eQ6VUP9 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tfap2eQ6VUP9 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tfap2eQ6VUP9 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tfap2eQ6VUP9 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tfap2eQ6VUP9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Tfap2eQ6VUP9 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Tfap2eQ6VUP9 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tfap2eQ6VUP9 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tfap2eQ6VUP9 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tfap2eQ6VUP9 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tfap2eQ6VUP9 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tfap2eQ6VUP9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tfap2eQ6VUP9 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tfap2eQ6VUP9 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tfap2eQ6VUP9 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tfap2eQ6VUP9 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tfap2eQ6VUP9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tfap2eQ6VUP9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tfap2eQ6VUP9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tfap2eQ6VUP9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tfap2eQ6VUP9 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tfap2eQ6VUP9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tfap2eQ6VUP9 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tfap2eQ6VUP9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tfap2eQ6VUP9 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tfap2eQ6VUP9 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tfap2eQ6VUP9 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tfap2eQ6VUP9 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tfap2eQ6VUP9 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tfap2eQ6VUP9 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tfap2eQ6VUP9 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tfap2eQ6VUP9 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tfap2eQ6VUP9 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tfap2eQ6VUP9 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tfap2eQ6VUP9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tfap2eQ6VUP9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tfap2eQ6VUP9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tfap2eQ6VUP9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tfap2eQ6VUP9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tfap2eQ6VUP9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tfap2eQ6VUP9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tfap2eQ6VUP9 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tfap2eQ6VUP9 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tfap2eQ6VUP9 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tfap2eQ6VUP9 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tfap2eQ6VUP9 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tfap2eQ6VUP9 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tfap2eQ6VUP9 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tfap2eQ6VUP9 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tfap2eQ6VUP9 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tfap2eQ6VUP9 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tfap2eQ6VUP9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tfap2eQ6VUP9 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tfap2eQ6VUP9 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tfap2eQ6VUP9 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tfap2eQ6VUP9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tfap2eQ6VUP9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tfap2eQ6VUP9 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tfap2eQ6VUP9 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tfap2eQ6VUP9 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tfap2eQ6VUP9 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tfap2eQ6VUP9 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms