Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gja6Q6S5G4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gja6Q6S5G4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gja6Q6S5G4 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gja6Q6S5G4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gja6Q6S5G4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gja6Q6S5G4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gja6Q6S5G4 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gja6Q6S5G4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gja6Q6S5G4 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gja6Q6S5G4 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gja6Q6S5G4 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gja6Q6S5G4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gja6Q6S5G4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gja6Q6S5G4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gja6Q6S5G4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gja6Q6S5G4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gja6Q6S5G4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gja6Q6S5G4 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gja6Q6S5G4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gja6Q6S5G4 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gja6Q6S5G4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gja6Q6S5G4 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gja6Q6S5G4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gja6Q6S5G4 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gja6Q6S5G4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gja6Q6S5G4 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gja6Q6S5G4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gja6Q6S5G4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gja6Q6S5G4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gja6Q6S5G4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gja6Q6S5G4 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gja6Q6S5G4 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gja6Q6S5G4 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Gja6Q6S5G4 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Gja6Q6S5G4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gja6Q6S5G4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gja6Q6S5G4 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gja6Q6S5G4 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gja6Q6S5G4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gja6Q6S5G4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gja6Q6S5G4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gja6Q6S5G4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gja6Q6S5G4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gja6Q6S5G4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gja6Q6S5G4 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gja6Q6S5G4 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gja6Q6S5G4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gja6Q6S5G4 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gja6Q6S5G4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gja6Q6S5G4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gja6Q6S5G4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gja6Q6S5G4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gja6Q6S5G4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gja6Q6S5G4 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gja6Q6S5G4 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gja6Q6S5G4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gja6Q6S5G4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gja6Q6S5G4 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gja6Q6S5G4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gja6Q6S5G4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gja6Q6S5G4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gja6Q6S5G4 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gja6Q6S5G4 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gja6Q6S5G4 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gja6Q6S5G4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Gja6Q6S5G4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gja6Q6S5G4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gja6Q6S5G4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gja6Q6S5G4 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gja6Q6S5G4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gja6Q6S5G4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gja6Q6S5G4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gja6Q6S5G4 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Gja6Q6S5G4 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gja6Q6S5G4 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gja6Q6S5G4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gja6Q6S5G4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gja6Q6S5G4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gja6Q6S5G4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gja6Q6S5G4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gja6Q6S5G4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gja6Q6S5G4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gja6Q6S5G4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gja6Q6S5G4 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gja6Q6S5G4 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gja6Q6S5G4 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gja6Q6S5G4 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gja6Q6S5G4 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gja6Q6S5G4 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gja6Q6S5G4 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gja6Q6S5G4 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gja6Q6S5G4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gja6Q6S5G4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gja6Q6S5G4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gja6Q6S5G4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gja6Q6S5G4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gja6Q6S5G4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gja6Q6S5G4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gja6Q6S5G4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms