Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUT8

Ccdc154, Coiled-coil domain-containing protein 154, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc154Q6RUT8 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc154Q6RUT8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc154Q6RUT8 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc154Q6RUT8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc154Q6RUT8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc154Q6RUT8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc154Q6RUT8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc154Q6RUT8 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc154Q6RUT8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc154Q6RUT8 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc154Q6RUT8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc154Q6RUT8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc154Q6RUT8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc154Q6RUT8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc154Q6RUT8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc154Q6RUT8 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc154Q6RUT8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc154Q6RUT8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc154Q6RUT8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc154Q6RUT8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc154Q6RUT8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc154Q6RUT8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc154Q6RUT8 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc154Q6RUT8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc154Q6RUT8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc154Q6RUT8 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc154Q6RUT8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc154Q6RUT8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc154Q6RUT8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc154Q6RUT8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc154Q6RUT8 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc154Q6RUT8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc154Q6RUT8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc154Q6RUT8 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc154Q6RUT8 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc154Q6RUT8 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc154Q6RUT8 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc154Q6RUT8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc154Q6RUT8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc154Q6RUT8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc154Q6RUT8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc154Q6RUT8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc154Q6RUT8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc154Q6RUT8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc154Q6RUT8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc154Q6RUT8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc154Q6RUT8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc154Q6RUT8 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc154Q6RUT8 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc154Q6RUT8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc154Q6RUT8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc154Q6RUT8 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc154Q6RUT8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc154Q6RUT8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc154Q6RUT8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc154Q6RUT8 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc154Q6RUT8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc154Q6RUT8 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc154Q6RUT8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc154Q6RUT8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc154Q6RUT8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc154Q6RUT8 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc154Q6RUT8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc154Q6RUT8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc154Q6RUT8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc154Q6RUT8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc154Q6RUT8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc154Q6RUT8 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc154Q6RUT8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc154Q6RUT8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc154Q6RUT8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ccdc154Q6RUT8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc154Q6RUT8 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc154Q6RUT8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc154Q6RUT8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc154Q6RUT8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc154Q6RUT8 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc154Q6RUT8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc154Q6RUT8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc154Q6RUT8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc154Q6RUT8 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ccdc154Q6RUT8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc154Q6RUT8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc154Q6RUT8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc154Q6RUT8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc154Q6RUT8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc154Q6RUT8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc154Q6RUT8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc154Q6RUT8 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc154Q6RUT8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc154Q6RUT8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc154Q6RUT8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc154Q6RUT8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc154Q6RUT8 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc154Q6RUT8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc154Q6RUT8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc154Q6RUT8 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ccdc154Q6RUT8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc154Q6RUT8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ccdc154Q6RUT8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms