Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2P8

Neil2, Endonuclease 8-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neil2Q6R2P8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Neil2Q6R2P8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Neil2Q6R2P8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Neil2Q6R2P8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Neil2Q6R2P8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Neil2Q6R2P8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Neil2Q6R2P8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Neil2Q6R2P8 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Neil2Q6R2P8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Neil2Q6R2P8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Neil2Q6R2P8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Neil2Q6R2P8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Neil2Q6R2P8 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Neil2Q6R2P8 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Neil2Q6R2P8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Neil2Q6R2P8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Neil2Q6R2P8 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Neil2Q6R2P8 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Neil2Q6R2P8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Neil2Q6R2P8 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Neil2Q6R2P8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Neil2Q6R2P8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Neil2Q6R2P8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Neil2Q6R2P8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Neil2Q6R2P8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Neil2Q6R2P8 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Neil2Q6R2P8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Neil2Q6R2P8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Neil2Q6R2P8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Neil2Q6R2P8 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Neil2Q6R2P8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Neil2Q6R2P8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Neil2Q6R2P8 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Neil2Q6R2P8 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Neil2Q6R2P8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Neil2Q6R2P8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Neil2Q6R2P8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Neil2Q6R2P8 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Neil2Q6R2P8 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Neil2Q6R2P8 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Neil2Q6R2P8 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Neil2Q6R2P8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Neil2Q6R2P8 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Neil2Q6R2P8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Neil2Q6R2P8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Neil2Q6R2P8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Neil2Q6R2P8 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Neil2Q6R2P8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Neil2Q6R2P8 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Neil2Q6R2P8 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Neil2Q6R2P8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Neil2Q6R2P8 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Neil2Q6R2P8 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Neil2Q6R2P8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Neil2Q6R2P8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Neil2Q6R2P8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Neil2Q6R2P8 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Neil2Q6R2P8 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Neil2Q6R2P8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Neil2Q6R2P8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Neil2Q6R2P8 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Neil2Q6R2P8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Neil2Q6R2P8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Neil2Q6R2P8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Neil2Q6R2P8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Neil2Q6R2P8 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Neil2Q6R2P8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Neil2Q6R2P8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Neil2Q6R2P8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Neil2Q6R2P8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Neil2Q6R2P8 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Neil2Q6R2P8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Neil2Q6R2P8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Neil2Q6R2P8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Neil2Q6R2P8 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Neil2Q6R2P8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Neil2Q6R2P8 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Neil2Q6R2P8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Neil2Q6R2P8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Neil2Q6R2P8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Neil2Q6R2P8 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Neil2Q6R2P8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Neil2Q6R2P8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Neil2Q6R2P8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Neil2Q6R2P8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Neil2Q6R2P8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Neil2Q6R2P8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Neil2Q6R2P8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Neil2Q6R2P8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Neil2Q6R2P8 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Neil2Q6R2P8 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Neil2Q6R2P8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Neil2Q6R2P8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Neil2Q6R2P8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Neil2Q6R2P8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Neil2Q6R2P8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Neil2Q6R2P8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Neil2Q6R2P8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Neil2Q6R2P8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Neil2Q6R2P8 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms