Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGF5

Bms1, BMS1 homolog, ribosome assembly protein (Yeast), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bms1Q6PGF5 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Bms1Q6PGF5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Bms1Q6PGF5 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Bms1Q6PGF5 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Bms1Q6PGF5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Bms1Q6PGF5 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bms1Q6PGF5 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bms1Q6PGF5 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bms1Q6PGF5 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bms1Q6PGF5 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Bms1Q6PGF5 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bms1Q6PGF5 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bms1Q6PGF5 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bms1Q6PGF5 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bms1Q6PGF5 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bms1Q6PGF5 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Bms1Q6PGF5 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Bms1Q6PGF5 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Bms1Q6PGF5 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Bms1Q6PGF5 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Bms1Q6PGF5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Bms1Q6PGF5 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Bms1Q6PGF5 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bms1Q6PGF5 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bms1Q6PGF5 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bms1Q6PGF5 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Bms1Q6PGF5 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bms1Q6PGF5 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bms1Q6PGF5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bms1Q6PGF5 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bms1Q6PGF5 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bms1Q6PGF5 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bms1Q6PGF5 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bms1Q6PGF5 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bms1Q6PGF5 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bms1Q6PGF5 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bms1Q6PGF5 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bms1Q6PGF5 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bms1Q6PGF5 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bms1Q6PGF5 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bms1Q6PGF5 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bms1Q6PGF5 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bms1Q6PGF5 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bms1Q6PGF5 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bms1Q6PGF5 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bms1Q6PGF5 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Bms1Q6PGF5 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bms1Q6PGF5 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bms1Q6PGF5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bms1Q6PGF5 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bms1Q6PGF5 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bms1Q6PGF5 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bms1Q6PGF5 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bms1Q6PGF5 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bms1Q6PGF5 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bms1Q6PGF5 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Bms1Q6PGF5 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Bms1Q6PGF5 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bms1Q6PGF5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bms1Q6PGF5 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bms1Q6PGF5 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bms1Q6PGF5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bms1Q6PGF5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bms1Q6PGF5 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bms1Q6PGF5 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bms1Q6PGF5 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bms1Q6PGF5 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bms1Q6PGF5 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Bms1Q6PGF5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bms1Q6PGF5 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bms1Q6PGF5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bms1Q6PGF5 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bms1Q6PGF5 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bms1Q6PGF5 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bms1Q6PGF5 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bms1Q6PGF5 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bms1Q6PGF5 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bms1Q6PGF5 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bms1Q6PGF5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bms1Q6PGF5 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bms1Q6PGF5 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bms1Q6PGF5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bms1Q6PGF5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Bms1Q6PGF5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Bms1Q6PGF5 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Bms1Q6PGF5 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Bms1Q6PGF5 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Bms1Q6PGF5 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Bms1Q6PGF5 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Bms1Q6PGF5 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Bms1Q6PGF5 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Bms1Q6PGF5 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Bms1Q6PGF5 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Bms1Q6PGF5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bms1Q6PGF5 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bms1Q6PGF5 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bms1Q6PGF5 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bms1Q6PGF5 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bms1Q6PGF5 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bms1Q6PGF5 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms