Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDQ2

Chd4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd4Q6PDQ2 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Chd4Q6PDQ2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Chd4Q6PDQ2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Chd4Q6PDQ2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Chd4Q6PDQ2 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chd4Q6PDQ2 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chd4Q6PDQ2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chd4Q6PDQ2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chd4Q6PDQ2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chd4Q6PDQ2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chd4Q6PDQ2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chd4Q6PDQ2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chd4Q6PDQ2 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chd4Q6PDQ2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chd4Q6PDQ2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chd4Q6PDQ2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chd4Q6PDQ2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chd4Q6PDQ2 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chd4Q6PDQ2 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chd4Q6PDQ2 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Chd4Q6PDQ2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chd4Q6PDQ2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chd4Q6PDQ2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chd4Q6PDQ2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chd4Q6PDQ2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Chd4Q6PDQ2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Chd4Q6PDQ2 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Chd4Q6PDQ2 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Chd4Q6PDQ2 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Chd4Q6PDQ2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Chd4Q6PDQ2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Chd4Q6PDQ2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Chd4Q6PDQ2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Chd4Q6PDQ2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Chd4Q6PDQ2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chd4Q6PDQ2 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Chd4Q6PDQ2 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Chd4Q6PDQ2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chd4Q6PDQ2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chd4Q6PDQ2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chd4Q6PDQ2 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chd4Q6PDQ2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chd4Q6PDQ2 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chd4Q6PDQ2 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chd4Q6PDQ2 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chd4Q6PDQ2 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chd4Q6PDQ2 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chd4Q6PDQ2 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chd4Q6PDQ2 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chd4Q6PDQ2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Chd4Q6PDQ2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Chd4Q6PDQ2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Chd4Q6PDQ2 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Chd4Q6PDQ2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Chd4Q6PDQ2 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Chd4Q6PDQ2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Chd4Q6PDQ2 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Chd4Q6PDQ2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Chd4Q6PDQ2 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Chd4Q6PDQ2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Chd4Q6PDQ2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Chd4Q6PDQ2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Chd4Q6PDQ2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Chd4Q6PDQ2 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Chd4Q6PDQ2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Chd4Q6PDQ2 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Chd4Q6PDQ2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Chd4Q6PDQ2 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Chd4Q6PDQ2 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Chd4Q6PDQ2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Chd4Q6PDQ2 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Chd4Q6PDQ2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Chd4Q6PDQ2 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
Chd4Q6PDQ2 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Chd4Q6PDQ2 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Chd4Q6PDQ2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Chd4Q6PDQ2 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Chd4Q6PDQ2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Chd4Q6PDQ2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Chd4Q6PDQ2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Chd4Q6PDQ2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Chd4Q6PDQ2 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Chd4Q6PDQ2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Chd4Q6PDQ2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Chd4Q6PDQ2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Chd4Q6PDQ2 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Chd4Q6PDQ2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Chd4Q6PDQ2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Chd4Q6PDQ2 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Chd4Q6PDQ2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Chd4Q6PDQ2 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Chd4Q6PDQ2 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Chd4Q6PDQ2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Chd4Q6PDQ2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Chd4Q6PDQ2 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Chd4Q6PDQ2 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Chd4Q6PDQ2 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Chd4Q6PDQ2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Chd4Q6PDQ2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Chd4Q6PDQ2 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms