Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDM4

Ccdc36, Interactor of HORMAD1 protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc36Q6PDM4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc36Q6PDM4 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc36Q6PDM4 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc36Q6PDM4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccdc36Q6PDM4 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc36Q6PDM4 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc36Q6PDM4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc36Q6PDM4 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc36Q6PDM4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc36Q6PDM4 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc36Q6PDM4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc36Q6PDM4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc36Q6PDM4 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc36Q6PDM4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc36Q6PDM4 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc36Q6PDM4 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc36Q6PDM4 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc36Q6PDM4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc36Q6PDM4 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc36Q6PDM4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc36Q6PDM4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc36Q6PDM4 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccdc36Q6PDM4 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc36Q6PDM4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc36Q6PDM4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc36Q6PDM4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc36Q6PDM4 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc36Q6PDM4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc36Q6PDM4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc36Q6PDM4 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc36Q6PDM4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc36Q6PDM4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc36Q6PDM4 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc36Q6PDM4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc36Q6PDM4 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc36Q6PDM4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc36Q6PDM4 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc36Q6PDM4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc36Q6PDM4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc36Q6PDM4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc36Q6PDM4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc36Q6PDM4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc36Q6PDM4 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc36Q6PDM4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc36Q6PDM4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc36Q6PDM4 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc36Q6PDM4 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc36Q6PDM4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc36Q6PDM4 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc36Q6PDM4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc36Q6PDM4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms