Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAR5

Gapvd1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gapvd1Q6PAR5 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Gapvd1Q6PAR5 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Gapvd1Q6PAR5 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Gapvd1Q6PAR5 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Gapvd1Q6PAR5 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Gapvd1Q6PAR5 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Gapvd1Q6PAR5 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Gapvd1Q6PAR5 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Gapvd1Q6PAR5 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Gapvd1Q6PAR5 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Gapvd1Q6PAR5 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Gapvd1Q6PAR5 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Gapvd1Q6PAR5 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Gapvd1Q6PAR5 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Gapvd1Q6PAR5 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Gapvd1Q6PAR5 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Gapvd1Q6PAR5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Gapvd1Q6PAR5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Gapvd1Q6PAR5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Gapvd1Q6PAR5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Gapvd1Q6PAR5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Gapvd1Q6PAR5 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Gapvd1Q6PAR5 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Gapvd1Q6PAR5 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Gapvd1Q6PAR5 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Gapvd1Q6PAR5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Gapvd1Q6PAR5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Gapvd1Q6PAR5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Gapvd1Q6PAR5 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Gapvd1Q6PAR5 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Gapvd1Q6PAR5 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Gapvd1Q6PAR5 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Gapvd1Q6PAR5 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Gapvd1Q6PAR5 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Gapvd1Q6PAR5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Gapvd1Q6PAR5 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Gapvd1Q6PAR5 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Gapvd1Q6PAR5 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Gapvd1Q6PAR5 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Gapvd1Q6PAR5 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Gapvd1Q6PAR5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Gapvd1Q6PAR5 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Gapvd1Q6PAR5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Gapvd1Q6PAR5 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Gapvd1Q6PAR5 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Gapvd1Q6PAR5 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Gapvd1Q6PAR5 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Gapvd1Q6PAR5 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Gapvd1Q6PAR5 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Gapvd1Q6PAR5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Gapvd1Q6PAR5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Gapvd1Q6PAR5 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Gapvd1Q6PAR5 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Gapvd1Q6PAR5 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Gapvd1Q6PAR5 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Gapvd1Q6PAR5 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Gapvd1Q6PAR5 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Gapvd1Q6PAR5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Gapvd1Q6PAR5 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Gapvd1Q6PAR5 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Gapvd1Q6PAR5 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Gapvd1Q6PAR5 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Gapvd1Q6PAR5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Gapvd1Q6PAR5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Gapvd1Q6PAR5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Gapvd1Q6PAR5 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Gapvd1Q6PAR5 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Gapvd1Q6PAR5 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Gapvd1Q6PAR5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Gapvd1Q6PAR5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Gapvd1Q6PAR5 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Gapvd1Q6PAR5 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Gapvd1Q6PAR5 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Gapvd1Q6PAR5 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Gapvd1Q6PAR5 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Gapvd1Q6PAR5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Gapvd1Q6PAR5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Gapvd1Q6PAR5 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Gapvd1Q6PAR5 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Gapvd1Q6PAR5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Gapvd1Q6PAR5 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Gapvd1Q6PAR5 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Gapvd1Q6PAR5 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Gapvd1Q6PAR5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Gapvd1Q6PAR5 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Gapvd1Q6PAR5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Gapvd1Q6PAR5 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Gapvd1Q6PAR5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Gapvd1Q6PAR5 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Gapvd1Q6PAR5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Gapvd1Q6PAR5 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Gapvd1Q6PAR5 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Gapvd1Q6PAR5 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Gapvd1Q6PAR5 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Gapvd1Q6PAR5 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Gapvd1Q6PAR5 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Gapvd1Q6PAR5 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Gapvd1Q6PAR5 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Gapvd1Q6PAR5 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Gapvd1Q6PAR5 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms