Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BC061212Q6P8K3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BC061212Q6P8K3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BC061212Q6P8K3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BC061212Q6P8K3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BC061212Q6P8K3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BC061212Q6P8K3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BC061212Q6P8K3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BC061212Q6P8K3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BC061212Q6P8K3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BC061212Q6P8K3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
BC061212Q6P8K3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BC061212Q6P8K3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BC061212Q6P8K3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BC061212Q6P8K3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BC061212Q6P8K3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BC061212Q6P8K3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BC061212Q6P8K3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BC061212Q6P8K3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BC061212Q6P8K3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BC061212Q6P8K3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BC061212Q6P8K3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BC061212Q6P8K3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BC061212Q6P8K3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BC061212Q6P8K3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
BC061212Q6P8K3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BC061212Q6P8K3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BC061212Q6P8K3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
BC061212Q6P8K3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BC061212Q6P8K3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BC061212Q6P8K3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
BC061212Q6P8K3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BC061212Q6P8K3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BC061212Q6P8K3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BC061212Q6P8K3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BC061212Q6P8K3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BC061212Q6P8K3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BC061212Q6P8K3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BC061212Q6P8K3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
BC061212Q6P8K3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
BC061212Q6P8K3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BC061212Q6P8K3 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
BC061212Q6P8K3 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
BC061212Q6P8K3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BC061212Q6P8K3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BC061212Q6P8K3 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BC061212Q6P8K3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
BC061212Q6P8K3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BC061212Q6P8K3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BC061212Q6P8K3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BC061212Q6P8K3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BC061212Q6P8K3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BC061212Q6P8K3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BC061212Q6P8K3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BC061212Q6P8K3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
BC061212Q6P8K3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BC061212Q6P8K3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BC061212Q6P8K3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
BC061212Q6P8K3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
BC061212Q6P8K3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BC061212Q6P8K3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
BC061212Q6P8K3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BC061212Q6P8K3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
BC061212Q6P8K3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BC061212Q6P8K3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BC061212Q6P8K3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BC061212Q6P8K3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BC061212Q6P8K3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BC061212Q6P8K3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BC061212Q6P8K3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BC061212Q6P8K3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BC061212Q6P8K3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BC061212Q6P8K3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BC061212Q6P8K3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BC061212Q6P8K3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BC061212Q6P8K3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BC061212Q6P8K3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BC061212Q6P8K3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BC061212Q6P8K3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BC061212Q6P8K3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BC061212Q6P8K3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BC061212Q6P8K3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BC061212Q6P8K3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BC061212Q6P8K3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BC061212Q6P8K3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17■□□□□ 0.31
BC061212Q6P8K3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BC061212Q6P8K3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BC061212Q6P8K3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BC061212Q6P8K3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BC061212Q6P8K3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BC061212Q6P8K3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BC061212Q6P8K3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BC061212Q6P8K3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BC061212Q6P8K3 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BC061212Q6P8K3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BC061212Q6P8K3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BC061212Q6P8K3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BC061212Q6P8K3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
BC061212Q6P8K3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BC061212Q6P8K3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms