Protein–RNA interactions for Protein: Q6P6J4

Alkbh2, DNA oxidative demethylase ALKBH2, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh2Q6P6J4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Alkbh2Q6P6J4 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Alkbh2Q6P6J4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Alkbh2Q6P6J4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Alkbh2Q6P6J4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Alkbh2Q6P6J4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Alkbh2Q6P6J4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Alkbh2Q6P6J4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Alkbh2Q6P6J4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Alkbh2Q6P6J4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Alkbh2Q6P6J4 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Alkbh2Q6P6J4 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Alkbh2Q6P6J4 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Alkbh2Q6P6J4 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Alkbh2Q6P6J4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Alkbh2Q6P6J4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Alkbh2Q6P6J4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Alkbh2Q6P6J4 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Alkbh2Q6P6J4 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Alkbh2Q6P6J4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Alkbh2Q6P6J4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Alkbh2Q6P6J4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Alkbh2Q6P6J4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Alkbh2Q6P6J4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Alkbh2Q6P6J4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Alkbh2Q6P6J4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Alkbh2Q6P6J4 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Alkbh2Q6P6J4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Alkbh2Q6P6J4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Alkbh2Q6P6J4 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Alkbh2Q6P6J4 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Alkbh2Q6P6J4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Alkbh2Q6P6J4 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Alkbh2Q6P6J4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Alkbh2Q6P6J4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Alkbh2Q6P6J4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Alkbh2Q6P6J4 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Alkbh2Q6P6J4 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Alkbh2Q6P6J4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Alkbh2Q6P6J4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Alkbh2Q6P6J4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Alkbh2Q6P6J4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Alkbh2Q6P6J4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Alkbh2Q6P6J4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Alkbh2Q6P6J4 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Alkbh2Q6P6J4 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Alkbh2Q6P6J4 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Alkbh2Q6P6J4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Alkbh2Q6P6J4 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Alkbh2Q6P6J4 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Alkbh2Q6P6J4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Alkbh2Q6P6J4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Alkbh2Q6P6J4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Alkbh2Q6P6J4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Alkbh2Q6P6J4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Alkbh2Q6P6J4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Alkbh2Q6P6J4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Alkbh2Q6P6J4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Alkbh2Q6P6J4 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Alkbh2Q6P6J4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Alkbh2Q6P6J4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Alkbh2Q6P6J4 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Alkbh2Q6P6J4 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Alkbh2Q6P6J4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Alkbh2Q6P6J4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Alkbh2Q6P6J4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Alkbh2Q6P6J4 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Alkbh2Q6P6J4 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Alkbh2Q6P6J4 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Alkbh2Q6P6J4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Alkbh2Q6P6J4 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Alkbh2Q6P6J4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Alkbh2Q6P6J4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Alkbh2Q6P6J4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Alkbh2Q6P6J4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Alkbh2Q6P6J4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Alkbh2Q6P6J4 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Alkbh2Q6P6J4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Alkbh2Q6P6J4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Alkbh2Q6P6J4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Alkbh2Q6P6J4 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Alkbh2Q6P6J4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Alkbh2Q6P6J4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Alkbh2Q6P6J4 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Alkbh2Q6P6J4 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Alkbh2Q6P6J4 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Alkbh2Q6P6J4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Alkbh2Q6P6J4 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Alkbh2Q6P6J4 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Alkbh2Q6P6J4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Alkbh2Q6P6J4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Alkbh2Q6P6J4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Alkbh2Q6P6J4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Alkbh2Q6P6J4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Alkbh2Q6P6J4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Alkbh2Q6P6J4 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Alkbh2Q6P6J4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Alkbh2Q6P6J4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Alkbh2Q6P6J4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Alkbh2Q6P6J4 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms