Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3Y9

Podnl1, Podocan-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Podnl1Q6P3Y9 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Podnl1Q6P3Y9 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Podnl1Q6P3Y9 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Podnl1Q6P3Y9 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Podnl1Q6P3Y9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Podnl1Q6P3Y9 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Podnl1Q6P3Y9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Podnl1Q6P3Y9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Podnl1Q6P3Y9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Podnl1Q6P3Y9 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Podnl1Q6P3Y9 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Podnl1Q6P3Y9 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Podnl1Q6P3Y9 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Podnl1Q6P3Y9 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Podnl1Q6P3Y9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Podnl1Q6P3Y9 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Podnl1Q6P3Y9 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Podnl1Q6P3Y9 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Podnl1Q6P3Y9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Podnl1Q6P3Y9 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Podnl1Q6P3Y9 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Podnl1Q6P3Y9 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Podnl1Q6P3Y9 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Podnl1Q6P3Y9 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Podnl1Q6P3Y9 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Podnl1Q6P3Y9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Podnl1Q6P3Y9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Podnl1Q6P3Y9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Podnl1Q6P3Y9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Podnl1Q6P3Y9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Podnl1Q6P3Y9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Podnl1Q6P3Y9 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Podnl1Q6P3Y9 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Podnl1Q6P3Y9 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Podnl1Q6P3Y9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Podnl1Q6P3Y9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Podnl1Q6P3Y9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Podnl1Q6P3Y9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Podnl1Q6P3Y9 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Podnl1Q6P3Y9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Podnl1Q6P3Y9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Podnl1Q6P3Y9 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Podnl1Q6P3Y9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Podnl1Q6P3Y9 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Podnl1Q6P3Y9 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Podnl1Q6P3Y9 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Podnl1Q6P3Y9 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Podnl1Q6P3Y9 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Podnl1Q6P3Y9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Podnl1Q6P3Y9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Podnl1Q6P3Y9 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Podnl1Q6P3Y9 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Podnl1Q6P3Y9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Podnl1Q6P3Y9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Podnl1Q6P3Y9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Podnl1Q6P3Y9 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Podnl1Q6P3Y9 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Podnl1Q6P3Y9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Podnl1Q6P3Y9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Podnl1Q6P3Y9 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Podnl1Q6P3Y9 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Podnl1Q6P3Y9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Podnl1Q6P3Y9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Podnl1Q6P3Y9 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Podnl1Q6P3Y9 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Podnl1Q6P3Y9 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Podnl1Q6P3Y9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Podnl1Q6P3Y9 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Podnl1Q6P3Y9 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Podnl1Q6P3Y9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Podnl1Q6P3Y9 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Podnl1Q6P3Y9 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Podnl1Q6P3Y9 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Podnl1Q6P3Y9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Podnl1Q6P3Y9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Podnl1Q6P3Y9 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Podnl1Q6P3Y9 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Podnl1Q6P3Y9 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Podnl1Q6P3Y9 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Podnl1Q6P3Y9 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Podnl1Q6P3Y9 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Podnl1Q6P3Y9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Podnl1Q6P3Y9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Podnl1Q6P3Y9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Podnl1Q6P3Y9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Podnl1Q6P3Y9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Podnl1Q6P3Y9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Podnl1Q6P3Y9 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Podnl1Q6P3Y9 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Podnl1Q6P3Y9 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Podnl1Q6P3Y9 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Podnl1Q6P3Y9 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Podnl1Q6P3Y9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Podnl1Q6P3Y9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Podnl1Q6P3Y9 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Podnl1Q6P3Y9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Podnl1Q6P3Y9 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Podnl1Q6P3Y9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Podnl1Q6P3Y9 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Podnl1Q6P3Y9 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms