Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3A2

Frg2f1, Expressed sequence AA415398, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frg2f1Q6P3A2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Frg2f1Q6P3A2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Frg2f1Q6P3A2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Frg2f1Q6P3A2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Frg2f1Q6P3A2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Frg2f1Q6P3A2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Frg2f1Q6P3A2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Frg2f1Q6P3A2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Frg2f1Q6P3A2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Frg2f1Q6P3A2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Frg2f1Q6P3A2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Frg2f1Q6P3A2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Frg2f1Q6P3A2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Frg2f1Q6P3A2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Frg2f1Q6P3A2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Frg2f1Q6P3A2 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Frg2f1Q6P3A2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Frg2f1Q6P3A2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Frg2f1Q6P3A2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Frg2f1Q6P3A2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Frg2f1Q6P3A2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Frg2f1Q6P3A2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Frg2f1Q6P3A2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Frg2f1Q6P3A2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Frg2f1Q6P3A2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Frg2f1Q6P3A2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Frg2f1Q6P3A2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Frg2f1Q6P3A2 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Frg2f1Q6P3A2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Frg2f1Q6P3A2 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Frg2f1Q6P3A2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Frg2f1Q6P3A2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Frg2f1Q6P3A2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Frg2f1Q6P3A2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Frg2f1Q6P3A2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Frg2f1Q6P3A2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Frg2f1Q6P3A2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Frg2f1Q6P3A2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Frg2f1Q6P3A2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Frg2f1Q6P3A2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Frg2f1Q6P3A2 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Frg2f1Q6P3A2 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Frg2f1Q6P3A2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Frg2f1Q6P3A2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Frg2f1Q6P3A2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Frg2f1Q6P3A2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Frg2f1Q6P3A2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Frg2f1Q6P3A2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Frg2f1Q6P3A2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Frg2f1Q6P3A2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Frg2f1Q6P3A2 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Frg2f1Q6P3A2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Frg2f1Q6P3A2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Frg2f1Q6P3A2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Frg2f1Q6P3A2 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Frg2f1Q6P3A2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Frg2f1Q6P3A2 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Frg2f1Q6P3A2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Frg2f1Q6P3A2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Frg2f1Q6P3A2 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Frg2f1Q6P3A2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Frg2f1Q6P3A2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Frg2f1Q6P3A2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Frg2f1Q6P3A2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Frg2f1Q6P3A2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Frg2f1Q6P3A2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Frg2f1Q6P3A2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Frg2f1Q6P3A2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Frg2f1Q6P3A2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Frg2f1Q6P3A2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Frg2f1Q6P3A2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Frg2f1Q6P3A2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Frg2f1Q6P3A2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Frg2f1Q6P3A2 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Frg2f1Q6P3A2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Frg2f1Q6P3A2 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Frg2f1Q6P3A2 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Frg2f1Q6P3A2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Frg2f1Q6P3A2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Frg2f1Q6P3A2 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Frg2f1Q6P3A2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Frg2f1Q6P3A2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Frg2f1Q6P3A2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Frg2f1Q6P3A2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Frg2f1Q6P3A2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Frg2f1Q6P3A2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Frg2f1Q6P3A2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Frg2f1Q6P3A2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Frg2f1Q6P3A2 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Frg2f1Q6P3A2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Frg2f1Q6P3A2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Frg2f1Q6P3A2 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Frg2f1Q6P3A2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Frg2f1Q6P3A2 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Frg2f1Q6P3A2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Frg2f1Q6P3A2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Frg2f1Q6P3A2 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Frg2f1Q6P3A2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Frg2f1Q6P3A2 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Frg2f1Q6P3A2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms