Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZQ4

Paxip1, PAX-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,056 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxip1Q6NZQ4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Paxip1Q6NZQ4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Paxip1Q6NZQ4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Paxip1Q6NZQ4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Paxip1Q6NZQ4 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Paxip1Q6NZQ4 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Paxip1Q6NZQ4 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Paxip1Q6NZQ4 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Paxip1Q6NZQ4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Paxip1Q6NZQ4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Paxip1Q6NZQ4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Paxip1Q6NZQ4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Paxip1Q6NZQ4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Paxip1Q6NZQ4 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Paxip1Q6NZQ4 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Paxip1Q6NZQ4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Paxip1Q6NZQ4 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Paxip1Q6NZQ4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Paxip1Q6NZQ4 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Paxip1Q6NZQ4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Paxip1Q6NZQ4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Paxip1Q6NZQ4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Paxip1Q6NZQ4 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Paxip1Q6NZQ4 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Paxip1Q6NZQ4 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Paxip1Q6NZQ4 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Paxip1Q6NZQ4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Paxip1Q6NZQ4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Paxip1Q6NZQ4 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Paxip1Q6NZQ4 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Paxip1Q6NZQ4 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Paxip1Q6NZQ4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Paxip1Q6NZQ4 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Paxip1Q6NZQ4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Paxip1Q6NZQ4 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Paxip1Q6NZQ4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Paxip1Q6NZQ4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Paxip1Q6NZQ4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Paxip1Q6NZQ4 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Paxip1Q6NZQ4 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Paxip1Q6NZQ4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Paxip1Q6NZQ4 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Paxip1Q6NZQ4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Paxip1Q6NZQ4 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Paxip1Q6NZQ4 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Paxip1Q6NZQ4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Paxip1Q6NZQ4 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Paxip1Q6NZQ4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Paxip1Q6NZQ4 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Paxip1Q6NZQ4 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Paxip1Q6NZQ4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Paxip1Q6NZQ4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Paxip1Q6NZQ4 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Paxip1Q6NZQ4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Paxip1Q6NZQ4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Paxip1Q6NZQ4 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Paxip1Q6NZQ4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Paxip1Q6NZQ4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Paxip1Q6NZQ4 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Paxip1Q6NZQ4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Paxip1Q6NZQ4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Paxip1Q6NZQ4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Paxip1Q6NZQ4 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Paxip1Q6NZQ4 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Paxip1Q6NZQ4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Paxip1Q6NZQ4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Paxip1Q6NZQ4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Paxip1Q6NZQ4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Paxip1Q6NZQ4 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Paxip1Q6NZQ4 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Paxip1Q6NZQ4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Paxip1Q6NZQ4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Paxip1Q6NZQ4 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Paxip1Q6NZQ4 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Paxip1Q6NZQ4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Paxip1Q6NZQ4 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Paxip1Q6NZQ4 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Paxip1Q6NZQ4 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Paxip1Q6NZQ4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Paxip1Q6NZQ4 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Paxip1Q6NZQ4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Paxip1Q6NZQ4 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Paxip1Q6NZQ4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Paxip1Q6NZQ4 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Paxip1Q6NZQ4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Paxip1Q6NZQ4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Paxip1Q6NZQ4 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Paxip1Q6NZQ4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Paxip1Q6NZQ4 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Paxip1Q6NZQ4 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Paxip1Q6NZQ4 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Paxip1Q6NZQ4 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Paxip1Q6NZQ4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Paxip1Q6NZQ4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Paxip1Q6NZQ4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Paxip1Q6NZQ4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Paxip1Q6NZQ4 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Paxip1Q6NZQ4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Paxip1Q6NZQ4 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Paxip1Q6NZQ4 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms