Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZK8

Ptpdc1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpdc1Q6NZK8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ptpdc1Q6NZK8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ptpdc1Q6NZK8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ptpdc1Q6NZK8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ptpdc1Q6NZK8 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ptpdc1Q6NZK8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ptpdc1Q6NZK8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ptpdc1Q6NZK8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ptpdc1Q6NZK8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ptpdc1Q6NZK8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ptpdc1Q6NZK8 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ptpdc1Q6NZK8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ptpdc1Q6NZK8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ptpdc1Q6NZK8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ptpdc1Q6NZK8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ptpdc1Q6NZK8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ptpdc1Q6NZK8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ptpdc1Q6NZK8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ptpdc1Q6NZK8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ptpdc1Q6NZK8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ptpdc1Q6NZK8 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ptpdc1Q6NZK8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ptpdc1Q6NZK8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ptpdc1Q6NZK8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ptpdc1Q6NZK8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ptpdc1Q6NZK8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ptpdc1Q6NZK8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ptpdc1Q6NZK8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ptpdc1Q6NZK8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ptpdc1Q6NZK8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ptpdc1Q6NZK8 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ptpdc1Q6NZK8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ptpdc1Q6NZK8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ptpdc1Q6NZK8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ptpdc1Q6NZK8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ptpdc1Q6NZK8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ptpdc1Q6NZK8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ptpdc1Q6NZK8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ptpdc1Q6NZK8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ptpdc1Q6NZK8 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ptpdc1Q6NZK8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ptpdc1Q6NZK8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ptpdc1Q6NZK8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ptpdc1Q6NZK8 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ptpdc1Q6NZK8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ptpdc1Q6NZK8 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ptpdc1Q6NZK8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ptpdc1Q6NZK8 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ptpdc1Q6NZK8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ptpdc1Q6NZK8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ptpdc1Q6NZK8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ptpdc1Q6NZK8 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ptpdc1Q6NZK8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ptpdc1Q6NZK8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ptpdc1Q6NZK8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ptpdc1Q6NZK8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ptpdc1Q6NZK8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ptpdc1Q6NZK8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ptpdc1Q6NZK8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ptpdc1Q6NZK8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ptpdc1Q6NZK8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ptpdc1Q6NZK8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ptpdc1Q6NZK8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ptpdc1Q6NZK8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ptpdc1Q6NZK8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ptpdc1Q6NZK8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ptpdc1Q6NZK8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ptpdc1Q6NZK8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ptpdc1Q6NZK8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ptpdc1Q6NZK8 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ptpdc1Q6NZK8 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ptpdc1Q6NZK8 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ptpdc1Q6NZK8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ptpdc1Q6NZK8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ptpdc1Q6NZK8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ptpdc1Q6NZK8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ptpdc1Q6NZK8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ptpdc1Q6NZK8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ptpdc1Q6NZK8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ptpdc1Q6NZK8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ptpdc1Q6NZK8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ptpdc1Q6NZK8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ptpdc1Q6NZK8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ptpdc1Q6NZK8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ptpdc1Q6NZK8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ptpdc1Q6NZK8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ptpdc1Q6NZK8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ptpdc1Q6NZK8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ptpdc1Q6NZK8 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ptpdc1Q6NZK8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ptpdc1Q6NZK8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ptpdc1Q6NZK8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ptpdc1Q6NZK8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ptpdc1Q6NZK8 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ptpdc1Q6NZK8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ptpdc1Q6NZK8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ptpdc1Q6NZK8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ptpdc1Q6NZK8 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ptpdc1Q6NZK8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ptpdc1Q6NZK8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms