Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXH3

Gpbp1, Vasculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1Q6NXH3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gpbp1Q6NXH3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gpbp1Q6NXH3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gpbp1Q6NXH3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gpbp1Q6NXH3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gpbp1Q6NXH3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gpbp1Q6NXH3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gpbp1Q6NXH3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gpbp1Q6NXH3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gpbp1Q6NXH3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gpbp1Q6NXH3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gpbp1Q6NXH3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gpbp1Q6NXH3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gpbp1Q6NXH3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gpbp1Q6NXH3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Gpbp1Q6NXH3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gpbp1Q6NXH3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gpbp1Q6NXH3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gpbp1Q6NXH3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gpbp1Q6NXH3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gpbp1Q6NXH3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gpbp1Q6NXH3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gpbp1Q6NXH3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gpbp1Q6NXH3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gpbp1Q6NXH3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gpbp1Q6NXH3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gpbp1Q6NXH3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gpbp1Q6NXH3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gpbp1Q6NXH3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gpbp1Q6NXH3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Gpbp1Q6NXH3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gpbp1Q6NXH3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Gpbp1Q6NXH3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gpbp1Q6NXH3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gpbp1Q6NXH3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gpbp1Q6NXH3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gpbp1Q6NXH3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Gpbp1Q6NXH3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gpbp1Q6NXH3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gpbp1Q6NXH3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gpbp1Q6NXH3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gpbp1Q6NXH3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gpbp1Q6NXH3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gpbp1Q6NXH3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gpbp1Q6NXH3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gpbp1Q6NXH3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gpbp1Q6NXH3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gpbp1Q6NXH3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gpbp1Q6NXH3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gpbp1Q6NXH3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gpbp1Q6NXH3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gpbp1Q6NXH3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gpbp1Q6NXH3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gpbp1Q6NXH3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gpbp1Q6NXH3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gpbp1Q6NXH3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Gpbp1Q6NXH3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gpbp1Q6NXH3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gpbp1Q6NXH3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gpbp1Q6NXH3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gpbp1Q6NXH3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gpbp1Q6NXH3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gpbp1Q6NXH3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gpbp1Q6NXH3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gpbp1Q6NXH3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gpbp1Q6NXH3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gpbp1Q6NXH3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gpbp1Q6NXH3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gpbp1Q6NXH3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gpbp1Q6NXH3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gpbp1Q6NXH3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gpbp1Q6NXH3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gpbp1Q6NXH3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gpbp1Q6NXH3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gpbp1Q6NXH3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gpbp1Q6NXH3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gpbp1Q6NXH3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gpbp1Q6NXH3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gpbp1Q6NXH3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gpbp1Q6NXH3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gpbp1Q6NXH3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gpbp1Q6NXH3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gpbp1Q6NXH3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gpbp1Q6NXH3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gpbp1Q6NXH3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gpbp1Q6NXH3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gpbp1Q6NXH3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gpbp1Q6NXH3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gpbp1Q6NXH3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gpbp1Q6NXH3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gpbp1Q6NXH3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gpbp1Q6NXH3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gpbp1Q6NXH3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gpbp1Q6NXH3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gpbp1Q6NXH3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gpbp1Q6NXH3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gpbp1Q6NXH3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gpbp1Q6NXH3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gpbp1Q6NXH3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gpbp1Q6NXH3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms