Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF9

Cpsf6, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf6Q6NVF9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpsf6Q6NVF9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpsf6Q6NVF9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpsf6Q6NVF9 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpsf6Q6NVF9 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpsf6Q6NVF9 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpsf6Q6NVF9 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpsf6Q6NVF9 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpsf6Q6NVF9 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpsf6Q6NVF9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpsf6Q6NVF9 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cpsf6Q6NVF9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cpsf6Q6NVF9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cpsf6Q6NVF9 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cpsf6Q6NVF9 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cpsf6Q6NVF9 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cpsf6Q6NVF9 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cpsf6Q6NVF9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cpsf6Q6NVF9 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cpsf6Q6NVF9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cpsf6Q6NVF9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cpsf6Q6NVF9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cpsf6Q6NVF9 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cpsf6Q6NVF9 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cpsf6Q6NVF9 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cpsf6Q6NVF9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cpsf6Q6NVF9 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cpsf6Q6NVF9 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cpsf6Q6NVF9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cpsf6Q6NVF9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cpsf6Q6NVF9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cpsf6Q6NVF9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cpsf6Q6NVF9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cpsf6Q6NVF9 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cpsf6Q6NVF9 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Cpsf6Q6NVF9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpsf6Q6NVF9 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpsf6Q6NVF9 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpsf6Q6NVF9 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpsf6Q6NVF9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpsf6Q6NVF9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpsf6Q6NVF9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpsf6Q6NVF9 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpsf6Q6NVF9 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpsf6Q6NVF9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpsf6Q6NVF9 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpsf6Q6NVF9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cpsf6Q6NVF9 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpsf6Q6NVF9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpsf6Q6NVF9 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpsf6Q6NVF9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpsf6Q6NVF9 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpsf6Q6NVF9 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpsf6Q6NVF9 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpsf6Q6NVF9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpsf6Q6NVF9 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpsf6Q6NVF9 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpsf6Q6NVF9 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpsf6Q6NVF9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpsf6Q6NVF9 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpsf6Q6NVF9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpsf6Q6NVF9 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpsf6Q6NVF9 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cpsf6Q6NVF9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpsf6Q6NVF9 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpsf6Q6NVF9 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpsf6Q6NVF9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpsf6Q6NVF9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpsf6Q6NVF9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpsf6Q6NVF9 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpsf6Q6NVF9 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpsf6Q6NVF9 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpsf6Q6NVF9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpsf6Q6NVF9 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpsf6Q6NVF9 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpsf6Q6NVF9 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpsf6Q6NVF9 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cpsf6Q6NVF9 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cpsf6Q6NVF9 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cpsf6Q6NVF9 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cpsf6Q6NVF9 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cpsf6Q6NVF9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cpsf6Q6NVF9 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cpsf6Q6NVF9 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cpsf6Q6NVF9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cpsf6Q6NVF9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cpsf6Q6NVF9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cpsf6Q6NVF9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cpsf6Q6NVF9 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cpsf6Q6NVF9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cpsf6Q6NVF9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cpsf6Q6NVF9 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cpsf6Q6NVF9 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cpsf6Q6NVF9 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cpsf6Q6NVF9 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cpsf6Q6NVF9 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cpsf6Q6NVF9 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cpsf6Q6NVF9 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cpsf6Q6NVF9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cpsf6Q6NVF9 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms