Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVD0

Frem2, FRAS1-related extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frem2Q6NVD0 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Frem2Q6NVD0 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Frem2Q6NVD0 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Frem2Q6NVD0 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Frem2Q6NVD0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Frem2Q6NVD0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Frem2Q6NVD0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Frem2Q6NVD0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Frem2Q6NVD0 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Frem2Q6NVD0 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Frem2Q6NVD0 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Frem2Q6NVD0 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Frem2Q6NVD0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Frem2Q6NVD0 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Frem2Q6NVD0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Frem2Q6NVD0 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Frem2Q6NVD0 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Frem2Q6NVD0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Frem2Q6NVD0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Frem2Q6NVD0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Frem2Q6NVD0 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Frem2Q6NVD0 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Frem2Q6NVD0 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Frem2Q6NVD0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Frem2Q6NVD0 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Frem2Q6NVD0 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Frem2Q6NVD0 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Frem2Q6NVD0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Frem2Q6NVD0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Frem2Q6NVD0 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Frem2Q6NVD0 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Frem2Q6NVD0 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Frem2Q6NVD0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Frem2Q6NVD0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Frem2Q6NVD0 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Frem2Q6NVD0 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Frem2Q6NVD0 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Frem2Q6NVD0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Frem2Q6NVD0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Frem2Q6NVD0 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Frem2Q6NVD0 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Frem2Q6NVD0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Frem2Q6NVD0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Frem2Q6NVD0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Frem2Q6NVD0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Frem2Q6NVD0 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Frem2Q6NVD0 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Frem2Q6NVD0 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Frem2Q6NVD0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Frem2Q6NVD0 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Frem2Q6NVD0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Frem2Q6NVD0 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Frem2Q6NVD0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18■□□□□ 0.47
Frem2Q6NVD0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Frem2Q6NVD0 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Frem2Q6NVD0 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Frem2Q6NVD0 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Frem2Q6NVD0 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Frem2Q6NVD0 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Frem2Q6NVD0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Frem2Q6NVD0 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Frem2Q6NVD0 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Frem2Q6NVD0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Frem2Q6NVD0 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Frem2Q6NVD0 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Frem2Q6NVD0 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Frem2Q6NVD0 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Frem2Q6NVD0 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Frem2Q6NVD0 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Frem2Q6NVD0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Frem2Q6NVD0 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Frem2Q6NVD0 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Frem2Q6NVD0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Frem2Q6NVD0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Frem2Q6NVD0 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Frem2Q6NVD0 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Frem2Q6NVD0 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Frem2Q6NVD0 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Frem2Q6NVD0 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Frem2Q6NVD0 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Frem2Q6NVD0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Frem2Q6NVD0 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Frem2Q6NVD0 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Frem2Q6NVD0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Frem2Q6NVD0 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Frem2Q6NVD0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Frem2Q6NVD0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Frem2Q6NVD0 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Frem2Q6NVD0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Frem2Q6NVD0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Frem2Q6NVD0 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Frem2Q6NVD0 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Frem2Q6NVD0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Frem2Q6NVD0 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Frem2Q6NVD0 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Frem2Q6NVD0 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Frem2Q6NVD0 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Frem2Q6NVD0 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Frem2Q6NVD0 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Frem2Q6NVD0 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms