Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS46

Pdcd11, Protein RRP5 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd11Q6NS46 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Pdcd11Q6NS46 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Pdcd11Q6NS46 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Pdcd11Q6NS46 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Pdcd11Q6NS46 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Pdcd11Q6NS46 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Pdcd11Q6NS46 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Pdcd11Q6NS46 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Pdcd11Q6NS46 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Pdcd11Q6NS46 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Pdcd11Q6NS46 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Pdcd11Q6NS46 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Pdcd11Q6NS46 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Pdcd11Q6NS46 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Pdcd11Q6NS46 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Pdcd11Q6NS46 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Pdcd11Q6NS46 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Pdcd11Q6NS46 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Pdcd11Q6NS46 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Pdcd11Q6NS46 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Pdcd11Q6NS46 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Pdcd11Q6NS46 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Pdcd11Q6NS46 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Pdcd11Q6NS46 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Pdcd11Q6NS46 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Pdcd11Q6NS46 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Pdcd11Q6NS46 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Pdcd11Q6NS46 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Pdcd11Q6NS46 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Pdcd11Q6NS46 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Pdcd11Q6NS46 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Pdcd11Q6NS46 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Pdcd11Q6NS46 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Pdcd11Q6NS46 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Pdcd11Q6NS46 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Pdcd11Q6NS46 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Pdcd11Q6NS46 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Pdcd11Q6NS46 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Pdcd11Q6NS46 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Pdcd11Q6NS46 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Pdcd11Q6NS46 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Pdcd11Q6NS46 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Pdcd11Q6NS46 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Pdcd11Q6NS46 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Pdcd11Q6NS46 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Pdcd11Q6NS46 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Pdcd11Q6NS46 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Pdcd11Q6NS46 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Pdcd11Q6NS46 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pdcd11Q6NS46 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pdcd11Q6NS46 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pdcd11Q6NS46 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pdcd11Q6NS46 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pdcd11Q6NS46 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pdcd11Q6NS46 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pdcd11Q6NS46 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pdcd11Q6NS46 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pdcd11Q6NS46 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pdcd11Q6NS46 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pdcd11Q6NS46 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pdcd11Q6NS46 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Pdcd11Q6NS46 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Pdcd11Q6NS46 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Pdcd11Q6NS46 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Pdcd11Q6NS46 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Pdcd11Q6NS46 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Pdcd11Q6NS46 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Pdcd11Q6NS46 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Pdcd11Q6NS46 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Pdcd11Q6NS46 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Pdcd11Q6NS46 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Pdcd11Q6NS46 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Pdcd11Q6NS46 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Pdcd11Q6NS46 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Pdcd11Q6NS46 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Pdcd11Q6NS46 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Pdcd11Q6NS46 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Pdcd11Q6NS46 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Pdcd11Q6NS46 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Pdcd11Q6NS46 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Pdcd11Q6NS46 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Pdcd11Q6NS46 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Pdcd11Q6NS46 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Pdcd11Q6NS46 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Pdcd11Q6NS46 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Pdcd11Q6NS46 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Pdcd11Q6NS46 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Pdcd11Q6NS46 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Pdcd11Q6NS46 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Pdcd11Q6NS46 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Pdcd11Q6NS46 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Pdcd11Q6NS46 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pdcd11Q6NS46 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pdcd11Q6NS46 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pdcd11Q6NS46 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pdcd11Q6NS46 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pdcd11Q6NS46 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pdcd11Q6NS46 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Pdcd11Q6NS46 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Pdcd11Q6NS46 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms