Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS45

Ccdc66, Coiled-coil domain-containing protein 66, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc66Q6NS45 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc66Q6NS45 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc66Q6NS45 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc66Q6NS45 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc66Q6NS45 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc66Q6NS45 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc66Q6NS45 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc66Q6NS45 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc66Q6NS45 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc66Q6NS45 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc66Q6NS45 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc66Q6NS45 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc66Q6NS45 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc66Q6NS45 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc66Q6NS45 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc66Q6NS45 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc66Q6NS45 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc66Q6NS45 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc66Q6NS45 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc66Q6NS45 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc66Q6NS45 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc66Q6NS45 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc66Q6NS45 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc66Q6NS45 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc66Q6NS45 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc66Q6NS45 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc66Q6NS45 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc66Q6NS45 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc66Q6NS45 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc66Q6NS45 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc66Q6NS45 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc66Q6NS45 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc66Q6NS45 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc66Q6NS45 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc66Q6NS45 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc66Q6NS45 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc66Q6NS45 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc66Q6NS45 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc66Q6NS45 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc66Q6NS45 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc66Q6NS45 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc66Q6NS45 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc66Q6NS45 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc66Q6NS45 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc66Q6NS45 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc66Q6NS45 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc66Q6NS45 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc66Q6NS45 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc66Q6NS45 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc66Q6NS45 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc66Q6NS45 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc66Q6NS45 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc66Q6NS45 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc66Q6NS45 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc66Q6NS45 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc66Q6NS45 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc66Q6NS45 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc66Q6NS45 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc66Q6NS45 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc66Q6NS45 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc66Q6NS45 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc66Q6NS45 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc66Q6NS45 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc66Q6NS45 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc66Q6NS45 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc66Q6NS45 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc66Q6NS45 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc66Q6NS45 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc66Q6NS45 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc66Q6NS45 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Ccdc66Q6NS45 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Ccdc66Q6NS45 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc66Q6NS45 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc66Q6NS45 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc66Q6NS45 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc66Q6NS45 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc66Q6NS45 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc66Q6NS45 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc66Q6NS45 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc66Q6NS45 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc66Q6NS45 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc66Q6NS45 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc66Q6NS45 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc66Q6NS45 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc66Q6NS45 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc66Q6NS45 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc66Q6NS45 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc66Q6NS45 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc66Q6NS45 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc66Q6NS45 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc66Q6NS45 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc66Q6NS45 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc66Q6NS45 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc66Q6NS45 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc66Q6NS45 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc66Q6NS45 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc66Q6NS45 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc66Q6NS45 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc66Q6NS45 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc66Q6NS45 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms