Protein–RNA interactions for Protein: Q6J756

Capn11, Calpain-11, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn11Q6J756 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Capn11Q6J756 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Capn11Q6J756 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Capn11Q6J756 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Capn11Q6J756 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Capn11Q6J756 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Capn11Q6J756 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Capn11Q6J756 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Capn11Q6J756 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Capn11Q6J756 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Capn11Q6J756 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Capn11Q6J756 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Capn11Q6J756 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Capn11Q6J756 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Capn11Q6J756 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Capn11Q6J756 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Capn11Q6J756 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Capn11Q6J756 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capn11Q6J756 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capn11Q6J756 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capn11Q6J756 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capn11Q6J756 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capn11Q6J756 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capn11Q6J756 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capn11Q6J756 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capn11Q6J756 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capn11Q6J756 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Capn11Q6J756 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capn11Q6J756 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capn11Q6J756 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capn11Q6J756 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capn11Q6J756 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capn11Q6J756 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capn11Q6J756 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capn11Q6J756 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capn11Q6J756 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capn11Q6J756 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capn11Q6J756 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capn11Q6J756 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capn11Q6J756 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Capn11Q6J756 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Capn11Q6J756 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Capn11Q6J756 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Capn11Q6J756 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Capn11Q6J756 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Capn11Q6J756 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Capn11Q6J756 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Capn11Q6J756 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Capn11Q6J756 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Capn11Q6J756 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Capn11Q6J756 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Capn11Q6J756 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Capn11Q6J756 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Capn11Q6J756 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Capn11Q6J756 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Capn11Q6J756 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Capn11Q6J756 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Capn11Q6J756 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Capn11Q6J756 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Capn11Q6J756 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Capn11Q6J756 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Capn11Q6J756 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Capn11Q6J756 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Capn11Q6J756 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Capn11Q6J756 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Capn11Q6J756 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Capn11Q6J756 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Capn11Q6J756 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Capn11Q6J756 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Capn11Q6J756 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Capn11Q6J756 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Capn11Q6J756 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Capn11Q6J756 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Capn11Q6J756 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Capn11Q6J756 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Capn11Q6J756 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Capn11Q6J756 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Capn11Q6J756 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Capn11Q6J756 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Capn11Q6J756 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Capn11Q6J756 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Capn11Q6J756 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Capn11Q6J756 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Capn11Q6J756 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Capn11Q6J756 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Capn11Q6J756 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Capn11Q6J756 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Capn11Q6J756 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Capn11Q6J756 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Capn11Q6J756 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Capn11Q6J756 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Capn11Q6J756 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Capn11Q6J756 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Capn11Q6J756 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Capn11Q6J756 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Capn11Q6J756 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Capn11Q6J756 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Capn11Q6J756 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Capn11Q6J756 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Capn11Q6J756 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms