Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ParpbpQ6IRT3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ParpbpQ6IRT3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ParpbpQ6IRT3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ParpbpQ6IRT3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ParpbpQ6IRT3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ParpbpQ6IRT3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ParpbpQ6IRT3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ParpbpQ6IRT3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ParpbpQ6IRT3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ParpbpQ6IRT3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ParpbpQ6IRT3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ParpbpQ6IRT3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ParpbpQ6IRT3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ParpbpQ6IRT3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ParpbpQ6IRT3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ParpbpQ6IRT3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ParpbpQ6IRT3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ParpbpQ6IRT3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ParpbpQ6IRT3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ParpbpQ6IRT3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ParpbpQ6IRT3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ParpbpQ6IRT3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ParpbpQ6IRT3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ParpbpQ6IRT3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ParpbpQ6IRT3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ParpbpQ6IRT3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ParpbpQ6IRT3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ParpbpQ6IRT3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ParpbpQ6IRT3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ParpbpQ6IRT3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ParpbpQ6IRT3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ParpbpQ6IRT3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ParpbpQ6IRT3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ParpbpQ6IRT3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ParpbpQ6IRT3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ParpbpQ6IRT3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ParpbpQ6IRT3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ParpbpQ6IRT3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ParpbpQ6IRT3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ParpbpQ6IRT3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
ParpbpQ6IRT3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ParpbpQ6IRT3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ParpbpQ6IRT3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ParpbpQ6IRT3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ParpbpQ6IRT3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ParpbpQ6IRT3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ParpbpQ6IRT3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ParpbpQ6IRT3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ParpbpQ6IRT3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ParpbpQ6IRT3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ParpbpQ6IRT3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ParpbpQ6IRT3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ParpbpQ6IRT3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ParpbpQ6IRT3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ParpbpQ6IRT3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ParpbpQ6IRT3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ParpbpQ6IRT3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ParpbpQ6IRT3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ParpbpQ6IRT3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ParpbpQ6IRT3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ParpbpQ6IRT3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ParpbpQ6IRT3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ParpbpQ6IRT3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ParpbpQ6IRT3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ParpbpQ6IRT3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ParpbpQ6IRT3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ParpbpQ6IRT3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ParpbpQ6IRT3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ParpbpQ6IRT3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ParpbpQ6IRT3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ParpbpQ6IRT3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ParpbpQ6IRT3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ParpbpQ6IRT3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ParpbpQ6IRT3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ParpbpQ6IRT3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ParpbpQ6IRT3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ParpbpQ6IRT3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ParpbpQ6IRT3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ParpbpQ6IRT3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ParpbpQ6IRT3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ParpbpQ6IRT3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ParpbpQ6IRT3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ParpbpQ6IRT3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ParpbpQ6IRT3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ParpbpQ6IRT3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ParpbpQ6IRT3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ParpbpQ6IRT3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ParpbpQ6IRT3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ParpbpQ6IRT3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ParpbpQ6IRT3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ParpbpQ6IRT3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ParpbpQ6IRT3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ParpbpQ6IRT3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ParpbpQ6IRT3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ParpbpQ6IRT3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ParpbpQ6IRT3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ParpbpQ6IRT3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ParpbpQ6IRT3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ParpbpQ6IRT3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms