Protein–RNA interactions for Protein: Q6IMF0

Krt87, Keratin, type II cuticular 87, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt87Q6IMF0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt87Q6IMF0 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt87Q6IMF0 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt87Q6IMF0 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt87Q6IMF0 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt87Q6IMF0 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt87Q6IMF0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt87Q6IMF0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt87Q6IMF0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt87Q6IMF0 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt87Q6IMF0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt87Q6IMF0 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt87Q6IMF0 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt87Q6IMF0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt87Q6IMF0 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt87Q6IMF0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt87Q6IMF0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt87Q6IMF0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt87Q6IMF0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt87Q6IMF0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt87Q6IMF0 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt87Q6IMF0 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt87Q6IMF0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt87Q6IMF0 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt87Q6IMF0 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt87Q6IMF0 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt87Q6IMF0 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt87Q6IMF0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Krt87Q6IMF0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Krt87Q6IMF0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Krt87Q6IMF0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Krt87Q6IMF0 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Krt87Q6IMF0 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Krt87Q6IMF0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Krt87Q6IMF0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Krt87Q6IMF0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Krt87Q6IMF0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Krt87Q6IMF0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Krt87Q6IMF0 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Krt87Q6IMF0 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Krt87Q6IMF0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Krt87Q6IMF0 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Krt87Q6IMF0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Krt87Q6IMF0 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Krt87Q6IMF0 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Krt87Q6IMF0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Krt87Q6IMF0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt87Q6IMF0 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt87Q6IMF0 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt87Q6IMF0 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt87Q6IMF0 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt87Q6IMF0 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt87Q6IMF0 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt87Q6IMF0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt87Q6IMF0 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt87Q6IMF0 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt87Q6IMF0 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt87Q6IMF0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt87Q6IMF0 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt87Q6IMF0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Krt87Q6IMF0 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt87Q6IMF0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt87Q6IMF0 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt87Q6IMF0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt87Q6IMF0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt87Q6IMF0 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt87Q6IMF0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt87Q6IMF0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt87Q6IMF0 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt87Q6IMF0 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt87Q6IMF0 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt87Q6IMF0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt87Q6IMF0 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt87Q6IMF0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt87Q6IMF0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Krt87Q6IMF0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt87Q6IMF0 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt87Q6IMF0 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt87Q6IMF0 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt87Q6IMF0 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt87Q6IMF0 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt87Q6IMF0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt87Q6IMF0 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt87Q6IMF0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt87Q6IMF0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt87Q6IMF0 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt87Q6IMF0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Krt87Q6IMF0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt87Q6IMF0 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt87Q6IMF0 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt87Q6IMF0 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt87Q6IMF0 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt87Q6IMF0 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt87Q6IMF0 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt87Q6IMF0 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt87Q6IMF0 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt87Q6IMF0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt87Q6IMF0 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt87Q6IMF0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Krt87Q6IMF0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms