Protein–RNA interactions for Protein: Q6I6G8

Hecw2, E3 ubiquitin-protein ligase HECW2, mousemouse

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw2Q6I6G8 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Hecw2Q6I6G8 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Hecw2Q6I6G8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Hecw2Q6I6G8 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Hecw2Q6I6G8 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Hecw2Q6I6G8 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Hecw2Q6I6G8 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Hecw2Q6I6G8 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Hecw2Q6I6G8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Hecw2Q6I6G8 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Hecw2Q6I6G8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Hecw2Q6I6G8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Hecw2Q6I6G8 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Hecw2Q6I6G8 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Hecw2Q6I6G8 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Hecw2Q6I6G8 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Hecw2Q6I6G8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Hecw2Q6I6G8 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Hecw2Q6I6G8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Hecw2Q6I6G8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Hecw2Q6I6G8 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Hecw2Q6I6G8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Hecw2Q6I6G8 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Hecw2Q6I6G8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Hecw2Q6I6G8 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Hecw2Q6I6G8 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Hecw2Q6I6G8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Hecw2Q6I6G8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Hecw2Q6I6G8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Hecw2Q6I6G8 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Hecw2Q6I6G8 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Hecw2Q6I6G8 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Hecw2Q6I6G8 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Hecw2Q6I6G8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Hecw2Q6I6G8 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Hecw2Q6I6G8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Hecw2Q6I6G8 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Hecw2Q6I6G8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Hecw2Q6I6G8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Hecw2Q6I6G8 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Hecw2Q6I6G8 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Hecw2Q6I6G8 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Hecw2Q6I6G8 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Hecw2Q6I6G8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Hecw2Q6I6G8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Hecw2Q6I6G8 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Hecw2Q6I6G8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Hecw2Q6I6G8 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Hecw2Q6I6G8 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Hecw2Q6I6G8 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Hecw2Q6I6G8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Hecw2Q6I6G8 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Hecw2Q6I6G8 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Hecw2Q6I6G8 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Hecw2Q6I6G8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Hecw2Q6I6G8 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Hecw2Q6I6G8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Hecw2Q6I6G8 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Hecw2Q6I6G8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Hecw2Q6I6G8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Hecw2Q6I6G8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Hecw2Q6I6G8 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Hecw2Q6I6G8 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Hecw2Q6I6G8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Hecw2Q6I6G8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Hecw2Q6I6G8 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Hecw2Q6I6G8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Hecw2Q6I6G8 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Hecw2Q6I6G8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Hecw2Q6I6G8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Hecw2Q6I6G8 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Hecw2Q6I6G8 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Hecw2Q6I6G8 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Hecw2Q6I6G8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Hecw2Q6I6G8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Hecw2Q6I6G8 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Hecw2Q6I6G8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Hecw2Q6I6G8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Hecw2Q6I6G8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Hecw2Q6I6G8 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Hecw2Q6I6G8 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Hecw2Q6I6G8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Hecw2Q6I6G8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Hecw2Q6I6G8 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Hecw2Q6I6G8 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Hecw2Q6I6G8 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Hecw2Q6I6G8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Hecw2Q6I6G8 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Hecw2Q6I6G8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Hecw2Q6I6G8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Hecw2Q6I6G8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Hecw2Q6I6G8 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Hecw2Q6I6G8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Hecw2Q6I6G8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Hecw2Q6I6G8 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Hecw2Q6I6G8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Hecw2Q6I6G8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Hecw2Q6I6G8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Hecw2Q6I6G8 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Hecw2Q6I6G8 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms