Protein–RNA interactions for Protein: Q6H1V1

Best3, Bestrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Best3Q6H1V1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Best3Q6H1V1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Best3Q6H1V1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Best3Q6H1V1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Best3Q6H1V1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Best3Q6H1V1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Best3Q6H1V1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Best3Q6H1V1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Best3Q6H1V1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Best3Q6H1V1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Best3Q6H1V1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Best3Q6H1V1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Best3Q6H1V1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Best3Q6H1V1 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Best3Q6H1V1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Best3Q6H1V1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Best3Q6H1V1 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Best3Q6H1V1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Best3Q6H1V1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Best3Q6H1V1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Best3Q6H1V1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Best3Q6H1V1 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Best3Q6H1V1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Best3Q6H1V1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Best3Q6H1V1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Best3Q6H1V1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Best3Q6H1V1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Best3Q6H1V1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Best3Q6H1V1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Best3Q6H1V1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Best3Q6H1V1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Best3Q6H1V1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Best3Q6H1V1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Best3Q6H1V1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Best3Q6H1V1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Best3Q6H1V1 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Best3Q6H1V1 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Best3Q6H1V1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Best3Q6H1V1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Best3Q6H1V1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Best3Q6H1V1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Best3Q6H1V1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Best3Q6H1V1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Best3Q6H1V1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Best3Q6H1V1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Best3Q6H1V1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Best3Q6H1V1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Best3Q6H1V1 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Best3Q6H1V1 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Best3Q6H1V1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Best3Q6H1V1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Best3Q6H1V1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Best3Q6H1V1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Best3Q6H1V1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Best3Q6H1V1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Best3Q6H1V1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Best3Q6H1V1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Best3Q6H1V1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Best3Q6H1V1 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Best3Q6H1V1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Best3Q6H1V1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Best3Q6H1V1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Best3Q6H1V1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Best3Q6H1V1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Best3Q6H1V1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Best3Q6H1V1 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Best3Q6H1V1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Best3Q6H1V1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Best3Q6H1V1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Best3Q6H1V1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Best3Q6H1V1 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Best3Q6H1V1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Best3Q6H1V1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Best3Q6H1V1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Best3Q6H1V1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Best3Q6H1V1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Best3Q6H1V1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Best3Q6H1V1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Best3Q6H1V1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Best3Q6H1V1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Best3Q6H1V1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Best3Q6H1V1 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Best3Q6H1V1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Best3Q6H1V1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Best3Q6H1V1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Best3Q6H1V1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Best3Q6H1V1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Best3Q6H1V1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Best3Q6H1V1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Best3Q6H1V1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Best3Q6H1V1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Best3Q6H1V1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Best3Q6H1V1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Best3Q6H1V1 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Best3Q6H1V1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Best3Q6H1V1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Best3Q6H1V1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Best3Q6H1V1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Best3Q6H1V1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Best3Q6H1V1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
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