Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQV7

Edrf1, Erythroid differentiation-related factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edrf1Q6GQV7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Edrf1Q6GQV7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Edrf1Q6GQV7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Edrf1Q6GQV7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Edrf1Q6GQV7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Edrf1Q6GQV7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Edrf1Q6GQV7 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Edrf1Q6GQV7 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Edrf1Q6GQV7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Edrf1Q6GQV7 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Edrf1Q6GQV7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Edrf1Q6GQV7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Edrf1Q6GQV7 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Edrf1Q6GQV7 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Edrf1Q6GQV7 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Edrf1Q6GQV7 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Edrf1Q6GQV7 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Edrf1Q6GQV7 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Edrf1Q6GQV7 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Edrf1Q6GQV7 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Edrf1Q6GQV7 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Edrf1Q6GQV7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Edrf1Q6GQV7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Edrf1Q6GQV7 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Edrf1Q6GQV7 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Edrf1Q6GQV7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Edrf1Q6GQV7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Edrf1Q6GQV7 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Edrf1Q6GQV7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Edrf1Q6GQV7 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Edrf1Q6GQV7 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Edrf1Q6GQV7 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Edrf1Q6GQV7 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Edrf1Q6GQV7 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Edrf1Q6GQV7 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Edrf1Q6GQV7 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Edrf1Q6GQV7 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Edrf1Q6GQV7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Edrf1Q6GQV7 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Edrf1Q6GQV7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Edrf1Q6GQV7 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Edrf1Q6GQV7 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Edrf1Q6GQV7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Edrf1Q6GQV7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Edrf1Q6GQV7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Edrf1Q6GQV7 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Edrf1Q6GQV7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Edrf1Q6GQV7 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Edrf1Q6GQV7 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Edrf1Q6GQV7 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Edrf1Q6GQV7 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Edrf1Q6GQV7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Edrf1Q6GQV7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Edrf1Q6GQV7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Edrf1Q6GQV7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Edrf1Q6GQV7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Edrf1Q6GQV7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Edrf1Q6GQV7 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Edrf1Q6GQV7 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Edrf1Q6GQV7 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Edrf1Q6GQV7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Edrf1Q6GQV7 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Edrf1Q6GQV7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Edrf1Q6GQV7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Edrf1Q6GQV7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Edrf1Q6GQV7 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Edrf1Q6GQV7 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Edrf1Q6GQV7 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Edrf1Q6GQV7 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Edrf1Q6GQV7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Edrf1Q6GQV7 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Edrf1Q6GQV7 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Edrf1Q6GQV7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Edrf1Q6GQV7 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Edrf1Q6GQV7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Edrf1Q6GQV7 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Edrf1Q6GQV7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Edrf1Q6GQV7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Edrf1Q6GQV7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Edrf1Q6GQV7 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Edrf1Q6GQV7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Edrf1Q6GQV7 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Edrf1Q6GQV7 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Edrf1Q6GQV7 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Edrf1Q6GQV7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Edrf1Q6GQV7 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Edrf1Q6GQV7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Edrf1Q6GQV7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Edrf1Q6GQV7 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Edrf1Q6GQV7 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Edrf1Q6GQV7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Edrf1Q6GQV7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Edrf1Q6GQV7 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Edrf1Q6GQV7 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Edrf1Q6GQV7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Edrf1Q6GQV7 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Edrf1Q6GQV7 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Edrf1Q6GQV7 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Edrf1Q6GQV7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Edrf1Q6GQV7 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms