Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQV1

Fam196b, Protein FAM196B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam196bQ6GQV1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam196bQ6GQV1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam196bQ6GQV1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam196bQ6GQV1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam196bQ6GQV1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam196bQ6GQV1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam196bQ6GQV1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam196bQ6GQV1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam196bQ6GQV1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam196bQ6GQV1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam196bQ6GQV1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam196bQ6GQV1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam196bQ6GQV1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam196bQ6GQV1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam196bQ6GQV1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam196bQ6GQV1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam196bQ6GQV1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam196bQ6GQV1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam196bQ6GQV1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Fam196bQ6GQV1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fam196bQ6GQV1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fam196bQ6GQV1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fam196bQ6GQV1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fam196bQ6GQV1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fam196bQ6GQV1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fam196bQ6GQV1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fam196bQ6GQV1 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Fam196bQ6GQV1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fam196bQ6GQV1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Fam196bQ6GQV1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Fam196bQ6GQV1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam196bQ6GQV1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam196bQ6GQV1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam196bQ6GQV1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam196bQ6GQV1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam196bQ6GQV1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam196bQ6GQV1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam196bQ6GQV1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam196bQ6GQV1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam196bQ6GQV1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam196bQ6GQV1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam196bQ6GQV1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam196bQ6GQV1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam196bQ6GQV1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam196bQ6GQV1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam196bQ6GQV1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam196bQ6GQV1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam196bQ6GQV1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam196bQ6GQV1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam196bQ6GQV1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam196bQ6GQV1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam196bQ6GQV1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam196bQ6GQV1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam196bQ6GQV1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam196bQ6GQV1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam196bQ6GQV1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam196bQ6GQV1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam196bQ6GQV1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam196bQ6GQV1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam196bQ6GQV1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fam196bQ6GQV1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam196bQ6GQV1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam196bQ6GQV1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam196bQ6GQV1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam196bQ6GQV1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam196bQ6GQV1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam196bQ6GQV1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam196bQ6GQV1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam196bQ6GQV1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam196bQ6GQV1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam196bQ6GQV1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam196bQ6GQV1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam196bQ6GQV1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam196bQ6GQV1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam196bQ6GQV1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam196bQ6GQV1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam196bQ6GQV1 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam196bQ6GQV1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam196bQ6GQV1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam196bQ6GQV1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam196bQ6GQV1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam196bQ6GQV1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam196bQ6GQV1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam196bQ6GQV1 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam196bQ6GQV1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam196bQ6GQV1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam196bQ6GQV1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam196bQ6GQV1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam196bQ6GQV1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam196bQ6GQV1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam196bQ6GQV1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam196bQ6GQV1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam196bQ6GQV1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam196bQ6GQV1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fam196bQ6GQV1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fam196bQ6GQV1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fam196bQ6GQV1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fam196bQ6GQV1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fam196bQ6GQV1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fam196bQ6GQV1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms