Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIA9

Fbxo27, F-box only protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo27Q6DIA9 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo27Q6DIA9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo27Q6DIA9 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo27Q6DIA9 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo27Q6DIA9 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo27Q6DIA9 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo27Q6DIA9 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo27Q6DIA9 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo27Q6DIA9 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fbxo27Q6DIA9 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo27Q6DIA9 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo27Q6DIA9 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo27Q6DIA9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo27Q6DIA9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo27Q6DIA9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo27Q6DIA9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo27Q6DIA9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo27Q6DIA9 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo27Q6DIA9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo27Q6DIA9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo27Q6DIA9 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo27Q6DIA9 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo27Q6DIA9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo27Q6DIA9 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo27Q6DIA9 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo27Q6DIA9 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fbxo27Q6DIA9 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxo27Q6DIA9 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxo27Q6DIA9 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxo27Q6DIA9 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxo27Q6DIA9 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxo27Q6DIA9 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxo27Q6DIA9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxo27Q6DIA9 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxo27Q6DIA9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxo27Q6DIA9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxo27Q6DIA9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxo27Q6DIA9 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxo27Q6DIA9 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxo27Q6DIA9 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxo27Q6DIA9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxo27Q6DIA9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fbxo27Q6DIA9 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Fbxo27Q6DIA9 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fbxo27Q6DIA9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fbxo27Q6DIA9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fbxo27Q6DIA9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fbxo27Q6DIA9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fbxo27Q6DIA9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fbxo27Q6DIA9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fbxo27Q6DIA9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fbxo27Q6DIA9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fbxo27Q6DIA9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fbxo27Q6DIA9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fbxo27Q6DIA9 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fbxo27Q6DIA9 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fbxo27Q6DIA9 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fbxo27Q6DIA9 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Fbxo27Q6DIA9 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fbxo27Q6DIA9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fbxo27Q6DIA9 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fbxo27Q6DIA9 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Fbxo27Q6DIA9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fbxo27Q6DIA9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Fbxo27Q6DIA9 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fbxo27Q6DIA9 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fbxo27Q6DIA9 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fbxo27Q6DIA9 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fbxo27Q6DIA9 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fbxo27Q6DIA9 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fbxo27Q6DIA9 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fbxo27Q6DIA9 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fbxo27Q6DIA9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fbxo27Q6DIA9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fbxo27Q6DIA9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fbxo27Q6DIA9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Fbxo27Q6DIA9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fbxo27Q6DIA9 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fbxo27Q6DIA9 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fbxo27Q6DIA9 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fbxo27Q6DIA9 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fbxo27Q6DIA9 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fbxo27Q6DIA9 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fbxo27Q6DIA9 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fbxo27Q6DIA9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fbxo27Q6DIA9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fbxo27Q6DIA9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Fbxo27Q6DIA9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fbxo27Q6DIA9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fbxo27Q6DIA9 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fbxo27Q6DIA9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fbxo27Q6DIA9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fbxo27Q6DIA9 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fbxo27Q6DIA9 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fbxo27Q6DIA9 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fbxo27Q6DIA9 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms