Protein–RNA interactions for Protein: Q6AXC6

Ddx11, ATP-dependent DNA helicase DDX11, mousemouse

Predictions only

Length 880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx11Q6AXC6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ddx11Q6AXC6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ddx11Q6AXC6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ddx11Q6AXC6 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ddx11Q6AXC6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ddx11Q6AXC6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddx11Q6AXC6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddx11Q6AXC6 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddx11Q6AXC6 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddx11Q6AXC6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddx11Q6AXC6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddx11Q6AXC6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddx11Q6AXC6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddx11Q6AXC6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddx11Q6AXC6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddx11Q6AXC6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddx11Q6AXC6 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddx11Q6AXC6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddx11Q6AXC6 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ddx11Q6AXC6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ddx11Q6AXC6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ddx11Q6AXC6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ddx11Q6AXC6 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ddx11Q6AXC6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ddx11Q6AXC6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ddx11Q6AXC6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ddx11Q6AXC6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ddx11Q6AXC6 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ddx11Q6AXC6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ddx11Q6AXC6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ddx11Q6AXC6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ddx11Q6AXC6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ddx11Q6AXC6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddx11Q6AXC6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddx11Q6AXC6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddx11Q6AXC6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddx11Q6AXC6 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddx11Q6AXC6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddx11Q6AXC6 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddx11Q6AXC6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddx11Q6AXC6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddx11Q6AXC6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddx11Q6AXC6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddx11Q6AXC6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddx11Q6AXC6 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddx11Q6AXC6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddx11Q6AXC6 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddx11Q6AXC6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddx11Q6AXC6 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddx11Q6AXC6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ddx11Q6AXC6 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ddx11Q6AXC6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ddx11Q6AXC6 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ddx11Q6AXC6 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ddx11Q6AXC6 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ddx11Q6AXC6 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ddx11Q6AXC6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ddx11Q6AXC6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ddx11Q6AXC6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ddx11Q6AXC6 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ddx11Q6AXC6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ddx11Q6AXC6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ddx11Q6AXC6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ddx11Q6AXC6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ddx11Q6AXC6 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ddx11Q6AXC6 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ddx11Q6AXC6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ddx11Q6AXC6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ddx11Q6AXC6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ddx11Q6AXC6 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ddx11Q6AXC6 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ddx11Q6AXC6 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ddx11Q6AXC6 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ddx11Q6AXC6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ddx11Q6AXC6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ddx11Q6AXC6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ddx11Q6AXC6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ddx11Q6AXC6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ddx11Q6AXC6 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ddx11Q6AXC6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ddx11Q6AXC6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ddx11Q6AXC6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ddx11Q6AXC6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddx11Q6AXC6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddx11Q6AXC6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddx11Q6AXC6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddx11Q6AXC6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddx11Q6AXC6 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddx11Q6AXC6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddx11Q6AXC6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddx11Q6AXC6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddx11Q6AXC6 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddx11Q6AXC6 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddx11Q6AXC6 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ddx11Q6AXC6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ddx11Q6AXC6 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ddx11Q6AXC6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ddx11Q6AXC6 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ddx11Q6AXC6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ddx11Q6AXC6 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms