Protein–RNA interactions for Protein: Q6A4J8

Usp7, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,103 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp7Q6A4J8 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp7Q6A4J8 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp7Q6A4J8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usp7Q6A4J8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Usp7Q6A4J8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Usp7Q6A4J8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp7Q6A4J8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp7Q6A4J8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp7Q6A4J8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp7Q6A4J8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp7Q6A4J8 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp7Q6A4J8 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp7Q6A4J8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp7Q6A4J8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp7Q6A4J8 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp7Q6A4J8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp7Q6A4J8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp7Q6A4J8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Usp7Q6A4J8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp7Q6A4J8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp7Q6A4J8 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp7Q6A4J8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp7Q6A4J8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp7Q6A4J8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp7Q6A4J8 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp7Q6A4J8 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp7Q6A4J8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp7Q6A4J8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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Usp7Q6A4J8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp7Q6A4J8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp7Q6A4J8 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp7Q6A4J8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp7Q6A4J8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp7Q6A4J8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Usp7Q6A4J8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp7Q6A4J8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp7Q6A4J8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp7Q6A4J8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp7Q6A4J8 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp7Q6A4J8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp7Q6A4J8 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp7Q6A4J8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp7Q6A4J8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp7Q6A4J8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp7Q6A4J8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Usp7Q6A4J8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp7Q6A4J8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp7Q6A4J8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp7Q6A4J8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp7Q6A4J8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp7Q6A4J8 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp7Q6A4J8 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
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Usp7Q6A4J8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp7Q6A4J8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp7Q6A4J8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp7Q6A4J8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp7Q6A4J8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp7Q6A4J8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp7Q6A4J8 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp7Q6A4J8 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Usp7Q6A4J8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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Usp7Q6A4J8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp7Q6A4J8 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp7Q6A4J8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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Usp7Q6A4J8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp7Q6A4J8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
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Usp7Q6A4J8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp7Q6A4J8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp7Q6A4J8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp7Q6A4J8 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp7Q6A4J8 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp7Q6A4J8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp7Q6A4J8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp7Q6A4J8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp7Q6A4J8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp7Q6A4J8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Usp7Q6A4J8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp7Q6A4J8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp7Q6A4J8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp7Q6A4J8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp7Q6A4J8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp7Q6A4J8 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Usp7Q6A4J8 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp7Q6A4J8 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp7Q6A4J8 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp7Q6A4J8 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp7Q6A4J8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp7Q6A4J8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp7Q6A4J8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp7Q6A4J8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp7Q6A4J8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp7Q6A4J8 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp7Q6A4J8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Usp7Q6A4J8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Usp7Q6A4J8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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