Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkp4Q68FH0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkp4Q68FH0 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkp4Q68FH0 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkp4Q68FH0 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkp4Q68FH0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkp4Q68FH0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkp4Q68FH0 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkp4Q68FH0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkp4Q68FH0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkp4Q68FH0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkp4Q68FH0 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkp4Q68FH0 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkp4Q68FH0 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkp4Q68FH0 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkp4Q68FH0 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pkp4Q68FH0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkp4Q68FH0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkp4Q68FH0 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkp4Q68FH0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkp4Q68FH0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkp4Q68FH0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkp4Q68FH0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkp4Q68FH0 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkp4Q68FH0 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkp4Q68FH0 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkp4Q68FH0 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkp4Q68FH0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkp4Q68FH0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkp4Q68FH0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pkp4Q68FH0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pkp4Q68FH0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pkp4Q68FH0 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pkp4Q68FH0 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Pkp4Q68FH0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pkp4Q68FH0 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pkp4Q68FH0 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pkp4Q68FH0 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pkp4Q68FH0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pkp4Q68FH0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pkp4Q68FH0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pkp4Q68FH0 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pkp4Q68FH0 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pkp4Q68FH0 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pkp4Q68FH0 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pkp4Q68FH0 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pkp4Q68FH0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pkp4Q68FH0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pkp4Q68FH0 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pkp4Q68FH0 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Pkp4Q68FH0 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pkp4Q68FH0 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pkp4Q68FH0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pkp4Q68FH0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pkp4Q68FH0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pkp4Q68FH0 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pkp4Q68FH0 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pkp4Q68FH0 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pkp4Q68FH0 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pkp4Q68FH0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pkp4Q68FH0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pkp4Q68FH0 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pkp4Q68FH0 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pkp4Q68FH0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms