Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT1

Lrrc8e, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8eQ66JT1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrrc8eQ66JT1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrrc8eQ66JT1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrrc8eQ66JT1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrrc8eQ66JT1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrrc8eQ66JT1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrrc8eQ66JT1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrrc8eQ66JT1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrrc8eQ66JT1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrrc8eQ66JT1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lrrc8eQ66JT1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrrc8eQ66JT1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrrc8eQ66JT1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrrc8eQ66JT1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrrc8eQ66JT1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrrc8eQ66JT1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrrc8eQ66JT1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrrc8eQ66JT1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrrc8eQ66JT1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrrc8eQ66JT1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrrc8eQ66JT1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrrc8eQ66JT1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrrc8eQ66JT1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrrc8eQ66JT1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrrc8eQ66JT1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrrc8eQ66JT1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrrc8eQ66JT1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lrrc8eQ66JT1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrrc8eQ66JT1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrrc8eQ66JT1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrrc8eQ66JT1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrrc8eQ66JT1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrrc8eQ66JT1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrrc8eQ66JT1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrrc8eQ66JT1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrrc8eQ66JT1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrrc8eQ66JT1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrrc8eQ66JT1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lrrc8eQ66JT1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrrc8eQ66JT1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrrc8eQ66JT1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrrc8eQ66JT1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrrc8eQ66JT1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrrc8eQ66JT1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrrc8eQ66JT1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrrc8eQ66JT1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrrc8eQ66JT1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrrc8eQ66JT1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrrc8eQ66JT1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrrc8eQ66JT1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrrc8eQ66JT1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrrc8eQ66JT1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrrc8eQ66JT1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrrc8eQ66JT1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrrc8eQ66JT1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrrc8eQ66JT1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Lrrc8eQ66JT1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Lrrc8eQ66JT1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrrc8eQ66JT1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrrc8eQ66JT1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrrc8eQ66JT1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrrc8eQ66JT1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrrc8eQ66JT1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrrc8eQ66JT1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrrc8eQ66JT1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrrc8eQ66JT1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrrc8eQ66JT1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrrc8eQ66JT1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrrc8eQ66JT1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrrc8eQ66JT1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrrc8eQ66JT1 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrrc8eQ66JT1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrrc8eQ66JT1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrrc8eQ66JT1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrrc8eQ66JT1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrrc8eQ66JT1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrrc8eQ66JT1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrrc8eQ66JT1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrrc8eQ66JT1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrrc8eQ66JT1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrrc8eQ66JT1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrrc8eQ66JT1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrrc8eQ66JT1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrrc8eQ66JT1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrrc8eQ66JT1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrrc8eQ66JT1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrrc8eQ66JT1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrrc8eQ66JT1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrrc8eQ66JT1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrrc8eQ66JT1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrrc8eQ66JT1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrrc8eQ66JT1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrrc8eQ66JT1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrrc8eQ66JT1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrrc8eQ66JT1 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrrc8eQ66JT1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrrc8eQ66JT1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrrc8eQ66JT1 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrrc8eQ66JT1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrrc8eQ66JT1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms