Protein–RNA interactions for Protein: Q64727

Vcl, Vinculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VclQ64727 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VclQ64727 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VclQ64727 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VclQ64727 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VclQ64727 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VclQ64727 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VclQ64727 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VclQ64727 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VclQ64727 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VclQ64727 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VclQ64727 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VclQ64727 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VclQ64727 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VclQ64727 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VclQ64727 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
VclQ64727 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VclQ64727 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VclQ64727 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VclQ64727 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VclQ64727 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
VclQ64727 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VclQ64727 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VclQ64727 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VclQ64727 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VclQ64727 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VclQ64727 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VclQ64727 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VclQ64727 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VclQ64727 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VclQ64727 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VclQ64727 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
VclQ64727 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VclQ64727 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
VclQ64727 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VclQ64727 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VclQ64727 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VclQ64727 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VclQ64727 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VclQ64727 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VclQ64727 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VclQ64727 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VclQ64727 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VclQ64727 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VclQ64727 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VclQ64727 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VclQ64727 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VclQ64727 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VclQ64727 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VclQ64727 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VclQ64727 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VclQ64727 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VclQ64727 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VclQ64727 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VclQ64727 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VclQ64727 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VclQ64727 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VclQ64727 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VclQ64727 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VclQ64727 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VclQ64727 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VclQ64727 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VclQ64727 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VclQ64727 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VclQ64727 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VclQ64727 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VclQ64727 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VclQ64727 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VclQ64727 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VclQ64727 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VclQ64727 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VclQ64727 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VclQ64727 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VclQ64727 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VclQ64727 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VclQ64727 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VclQ64727 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VclQ64727 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VclQ64727 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VclQ64727 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VclQ64727 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
VclQ64727 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VclQ64727 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VclQ64727 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VclQ64727 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VclQ64727 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VclQ64727 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VclQ64727 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VclQ64727 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VclQ64727 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VclQ64727 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VclQ64727 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VclQ64727 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
VclQ64727 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VclQ64727 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VclQ64727 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VclQ64727 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VclQ64727 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VclQ64727 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VclQ64727 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VclQ64727 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms