Protein–RNA interactions for Protein: Q64016

Defa17, Alpha-defensin 17 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 82 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa17Q64016 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Defa17Q64016 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Defa17Q64016 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Defa17Q64016 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Defa17Q64016 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Defa17Q64016 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Defa17Q64016 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Defa17Q64016 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Defa17Q64016 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Defa17Q64016 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Defa17Q64016 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Defa17Q64016 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Defa17Q64016 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Defa17Q64016 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Defa17Q64016 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Defa17Q64016 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Defa17Q64016 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Defa17Q64016 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Defa17Q64016 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Defa17Q64016 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Defa17Q64016 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Defa17Q64016 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Defa17Q64016 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Defa17Q64016 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Defa17Q64016 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Defa17Q64016 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Defa17Q64016 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Defa17Q64016 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Defa17Q64016 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Defa17Q64016 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Defa17Q64016 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Defa17Q64016 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Defa17Q64016 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Defa17Q64016 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Defa17Q64016 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Defa17Q64016 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Defa17Q64016 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Defa17Q64016 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Defa17Q64016 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Defa17Q64016 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Defa17Q64016 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Defa17Q64016 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Defa17Q64016 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Defa17Q64016 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Defa17Q64016 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Defa17Q64016 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Defa17Q64016 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Defa17Q64016 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Defa17Q64016 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Defa17Q64016 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Defa17Q64016 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Defa17Q64016 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Defa17Q64016 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Defa17Q64016 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Defa17Q64016 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Defa17Q64016 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Defa17Q64016 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Defa17Q64016 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Defa17Q64016 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Defa17Q64016 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Defa17Q64016 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Defa17Q64016 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Defa17Q64016 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Defa17Q64016 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Defa17Q64016 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Defa17Q64016 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Defa17Q64016 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Defa17Q64016 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Defa17Q64016 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Defa17Q64016 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Defa17Q64016 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Defa17Q64016 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Defa17Q64016 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Defa17Q64016 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Defa17Q64016 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Defa17Q64016 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Defa17Q64016 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Defa17Q64016 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Defa17Q64016 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Defa17Q64016 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Defa17Q64016 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Defa17Q64016 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Defa17Q64016 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Defa17Q64016 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Defa17Q64016 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Defa17Q64016 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Defa17Q64016 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Defa17Q64016 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Defa17Q64016 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Defa17Q64016 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Defa17Q64016 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Defa17Q64016 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Defa17Q64016 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Defa17Q64016 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Defa17Q64016 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Defa17Q64016 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Defa17Q64016 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Defa17Q64016 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Defa17Q64016 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Defa17Q64016 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms