Protein–RNA interactions for Protein: Q62559

Ift52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift52Q62559 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ift52Q62559 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ift52Q62559 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ift52Q62559 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ift52Q62559 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ift52Q62559 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ift52Q62559 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ift52Q62559 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ift52Q62559 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ift52Q62559 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ift52Q62559 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ift52Q62559 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ift52Q62559 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ift52Q62559 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ift52Q62559 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ift52Q62559 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ift52Q62559 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ift52Q62559 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ift52Q62559 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ift52Q62559 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ift52Q62559 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ift52Q62559 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ift52Q62559 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ift52Q62559 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ift52Q62559 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ift52Q62559 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ift52Q62559 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ift52Q62559 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ift52Q62559 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ift52Q62559 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ift52Q62559 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ift52Q62559 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ift52Q62559 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ift52Q62559 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ift52Q62559 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ift52Q62559 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ift52Q62559 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ift52Q62559 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ift52Q62559 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ift52Q62559 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ift52Q62559 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ift52Q62559 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ift52Q62559 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ift52Q62559 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ift52Q62559 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ift52Q62559 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ift52Q62559 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ift52Q62559 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ift52Q62559 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ift52Q62559 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ift52Q62559 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ift52Q62559 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ift52Q62559 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ift52Q62559 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ift52Q62559 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ift52Q62559 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ift52Q62559 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ift52Q62559 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ift52Q62559 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ift52Q62559 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ift52Q62559 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ift52Q62559 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ift52Q62559 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ift52Q62559 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ift52Q62559 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ift52Q62559 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ift52Q62559 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ift52Q62559 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ift52Q62559 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ift52Q62559 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ift52Q62559 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ift52Q62559 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ift52Q62559 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ift52Q62559 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ift52Q62559 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ift52Q62559 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ift52Q62559 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ift52Q62559 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ift52Q62559 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ift52Q62559 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ift52Q62559 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ift52Q62559 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ift52Q62559 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ift52Q62559 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ift52Q62559 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ift52Q62559 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ift52Q62559 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ift52Q62559 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ift52Q62559 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ift52Q62559 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ift52Q62559 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ift52Q62559 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ift52Q62559 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ift52Q62559 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ift52Q62559 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ift52Q62559 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ift52Q62559 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ift52Q62559 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ift52Q62559 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ift52Q62559 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms