Protein–RNA interactions for Protein: Q62470

Itga3, Integrin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga3Q62470 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Itga3Q62470 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Itga3Q62470 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Itga3Q62470 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Itga3Q62470 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Itga3Q62470 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Itga3Q62470 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Itga3Q62470 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Itga3Q62470 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Itga3Q62470 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Itga3Q62470 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Itga3Q62470 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Itga3Q62470 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Itga3Q62470 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Itga3Q62470 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Itga3Q62470 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Itga3Q62470 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Itga3Q62470 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Itga3Q62470 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Itga3Q62470 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Itga3Q62470 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Itga3Q62470 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itga3Q62470 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itga3Q62470 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itga3Q62470 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itga3Q62470 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itga3Q62470 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itga3Q62470 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itga3Q62470 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itga3Q62470 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itga3Q62470 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itga3Q62470 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itga3Q62470 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itga3Q62470 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itga3Q62470 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Itga3Q62470 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itga3Q62470 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itga3Q62470 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itga3Q62470 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itga3Q62470 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itga3Q62470 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itga3Q62470 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Itga3Q62470 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Itga3Q62470 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Itga3Q62470 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Itga3Q62470 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Itga3Q62470 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Itga3Q62470 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Itga3Q62470 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Itga3Q62470 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Itga3Q62470 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Itga3Q62470 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Itga3Q62470 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Itga3Q62470 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Itga3Q62470 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Itga3Q62470 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Itga3Q62470 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Itga3Q62470 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Itga3Q62470 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Itga3Q62470 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Itga3Q62470 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Itga3Q62470 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Itga3Q62470 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Itga3Q62470 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Itga3Q62470 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Itga3Q62470 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Itga3Q62470 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Itga3Q62470 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Itga3Q62470 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Itga3Q62470 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Itga3Q62470 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Itga3Q62470 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Itga3Q62470 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Itga3Q62470 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Itga3Q62470 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Itga3Q62470 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Itga3Q62470 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Itga3Q62470 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Itga3Q62470 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Itga3Q62470 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Itga3Q62470 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Itga3Q62470 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Itga3Q62470 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Itga3Q62470 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Itga3Q62470 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Itga3Q62470 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Itga3Q62470 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Itga3Q62470 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Itga3Q62470 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Itga3Q62470 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Itga3Q62470 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Itga3Q62470 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Itga3Q62470 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Itga3Q62470 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Itga3Q62470 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Itga3Q62470 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Itga3Q62470 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Itga3Q62470 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Itga3Q62470 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Itga3Q62470 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms