Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxa13Q62424 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxa13Q62424 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxa13Q62424 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxa13Q62424 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxa13Q62424 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxa13Q62424 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxa13Q62424 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxa13Q62424 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Hoxa13Q62424 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxa13Q62424 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxa13Q62424 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxa13Q62424 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Hoxa13Q62424 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxa13Q62424 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxa13Q62424 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxa13Q62424 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxa13Q62424 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxa13Q62424 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxa13Q62424 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxa13Q62424 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxa13Q62424 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxa13Q62424 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxa13Q62424 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxa13Q62424 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxa13Q62424 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxa13Q62424 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxa13Q62424 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxa13Q62424 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxa13Q62424 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxa13Q62424 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxa13Q62424 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxa13Q62424 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxa13Q62424 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxa13Q62424 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxa13Q62424 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxa13Q62424 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxa13Q62424 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxa13Q62424 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxa13Q62424 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxa13Q62424 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxa13Q62424 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxa13Q62424 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxa13Q62424 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxa13Q62424 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxa13Q62424 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxa13Q62424 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxa13Q62424 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxa13Q62424 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxa13Q62424 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxa13Q62424 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxa13Q62424 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxa13Q62424 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxa13Q62424 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxa13Q62424 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxa13Q62424 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxa13Q62424 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxa13Q62424 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxa13Q62424 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxa13Q62424 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxa13Q62424 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxa13Q62424 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxa13Q62424 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxa13Q62424 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxa13Q62424 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxa13Q62424 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxa13Q62424 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxa13Q62424 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hoxa13Q62424 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxa13Q62424 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxa13Q62424 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxa13Q62424 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxa13Q62424 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxa13Q62424 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxa13Q62424 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxa13Q62424 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxa13Q62424 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxa13Q62424 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxa13Q62424 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxa13Q62424 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxa13Q62424 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxa13Q62424 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hoxa13Q62424 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxa13Q62424 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxa13Q62424 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxa13Q62424 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxa13Q62424 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxa13Q62424 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxa13Q62424 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxa13Q62424 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxa13Q62424 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxa13Q62424 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxa13Q62424 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxa13Q62424 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxa13Q62424 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hoxa13Q62424 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxa13Q62424 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxa13Q62424 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxa13Q62424 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxa13Q62424 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms