Protein–RNA interactions for Protein: Q62388

Atm, Serine-protein kinase ATM, mousemouse

Predictions only

Length 3,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtmQ62388 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AtmQ62388 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
AtmQ62388 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
AtmQ62388 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AtmQ62388 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AtmQ62388 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AtmQ62388 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AtmQ62388 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AtmQ62388 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AtmQ62388 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AtmQ62388 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AtmQ62388 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AtmQ62388 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AtmQ62388 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AtmQ62388 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AtmQ62388 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
AtmQ62388 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AtmQ62388 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AtmQ62388 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AtmQ62388 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AtmQ62388 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18■□□□□ 0.47
AtmQ62388 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AtmQ62388 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AtmQ62388 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AtmQ62388 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AtmQ62388 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
AtmQ62388 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AtmQ62388 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AtmQ62388 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
AtmQ62388 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AtmQ62388 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AtmQ62388 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AtmQ62388 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AtmQ62388 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AtmQ62388 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AtmQ62388 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AtmQ62388 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AtmQ62388 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AtmQ62388 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
AtmQ62388 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AtmQ62388 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
AtmQ62388 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AtmQ62388 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AtmQ62388 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AtmQ62388 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AtmQ62388 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AtmQ62388 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AtmQ62388 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AtmQ62388 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AtmQ62388 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AtmQ62388 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AtmQ62388 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AtmQ62388 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
AtmQ62388 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
AtmQ62388 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AtmQ62388 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AtmQ62388 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AtmQ62388 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AtmQ62388 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AtmQ62388 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AtmQ62388 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AtmQ62388 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AtmQ62388 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AtmQ62388 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AtmQ62388 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AtmQ62388 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AtmQ62388 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AtmQ62388 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AtmQ62388 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AtmQ62388 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AtmQ62388 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AtmQ62388 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AtmQ62388 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AtmQ62388 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AtmQ62388 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AtmQ62388 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AtmQ62388 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AtmQ62388 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
AtmQ62388 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
AtmQ62388 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
AtmQ62388 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
AtmQ62388 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AtmQ62388 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AtmQ62388 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AtmQ62388 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AtmQ62388 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AtmQ62388 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AtmQ62388 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AtmQ62388 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AtmQ62388 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AtmQ62388 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AtmQ62388 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
AtmQ62388 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
AtmQ62388 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
AtmQ62388 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AtmQ62388 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
AtmQ62388 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
AtmQ62388 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
AtmQ62388 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
AtmQ62388 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms