Protein–RNA interactions for Protein: Q62383

Supt6h, Transcription elongation factor SPT6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt6hQ62383 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Supt6hQ62383 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Supt6hQ62383 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Supt6hQ62383 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Supt6hQ62383 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Supt6hQ62383 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Supt6hQ62383 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Supt6hQ62383 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Supt6hQ62383 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Supt6hQ62383 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Supt6hQ62383 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Supt6hQ62383 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Supt6hQ62383 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Supt6hQ62383 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Supt6hQ62383 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Supt6hQ62383 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Supt6hQ62383 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Supt6hQ62383 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Supt6hQ62383 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Supt6hQ62383 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Supt6hQ62383 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Supt6hQ62383 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Supt6hQ62383 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Supt6hQ62383 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Supt6hQ62383 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Supt6hQ62383 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Supt6hQ62383 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Supt6hQ62383 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Supt6hQ62383 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Supt6hQ62383 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Supt6hQ62383 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Supt6hQ62383 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Supt6hQ62383 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Supt6hQ62383 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Supt6hQ62383 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Supt6hQ62383 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Supt6hQ62383 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Supt6hQ62383 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Supt6hQ62383 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Supt6hQ62383 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Supt6hQ62383 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Supt6hQ62383 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Supt6hQ62383 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Supt6hQ62383 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Supt6hQ62383 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Supt6hQ62383 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Supt6hQ62383 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Supt6hQ62383 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Supt6hQ62383 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Supt6hQ62383 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Supt6hQ62383 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Supt6hQ62383 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Supt6hQ62383 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Supt6hQ62383 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Supt6hQ62383 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Supt6hQ62383 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Supt6hQ62383 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Supt6hQ62383 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Supt6hQ62383 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Supt6hQ62383 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Supt6hQ62383 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Supt6hQ62383 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Supt6hQ62383 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Supt6hQ62383 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Supt6hQ62383 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Supt6hQ62383 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Supt6hQ62383 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Supt6hQ62383 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Supt6hQ62383 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Supt6hQ62383 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Supt6hQ62383 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Supt6hQ62383 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Supt6hQ62383 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Supt6hQ62383 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Supt6hQ62383 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Supt6hQ62383 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Supt6hQ62383 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Supt6hQ62383 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Supt6hQ62383 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Supt6hQ62383 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Supt6hQ62383 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Supt6hQ62383 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Supt6hQ62383 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Supt6hQ62383 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Supt6hQ62383 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Supt6hQ62383 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Supt6hQ62383 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Supt6hQ62383 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Supt6hQ62383 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Supt6hQ62383 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Supt6hQ62383 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Supt6hQ62383 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Supt6hQ62383 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Supt6hQ62383 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Supt6hQ62383 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Supt6hQ62383 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Supt6hQ62383 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Supt6hQ62383 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Supt6hQ62383 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Supt6hQ62383 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms