Protein–RNA interactions for Protein: Q62361

Trh, Pro-thyrotropin-releasing hormone, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrhQ62361 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TrhQ62361 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TrhQ62361 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TrhQ62361 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TrhQ62361 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TrhQ62361 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TrhQ62361 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TrhQ62361 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TrhQ62361 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TrhQ62361 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TrhQ62361 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TrhQ62361 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TrhQ62361 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TrhQ62361 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TrhQ62361 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TrhQ62361 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TrhQ62361 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TrhQ62361 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TrhQ62361 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TrhQ62361 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TrhQ62361 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TrhQ62361 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TrhQ62361 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TrhQ62361 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TrhQ62361 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TrhQ62361 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TrhQ62361 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TrhQ62361 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TrhQ62361 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TrhQ62361 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TrhQ62361 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TrhQ62361 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TrhQ62361 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TrhQ62361 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TrhQ62361 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TrhQ62361 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TrhQ62361 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TrhQ62361 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TrhQ62361 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TrhQ62361 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TrhQ62361 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TrhQ62361 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TrhQ62361 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TrhQ62361 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TrhQ62361 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TrhQ62361 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TrhQ62361 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TrhQ62361 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TrhQ62361 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TrhQ62361 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TrhQ62361 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TrhQ62361 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TrhQ62361 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TrhQ62361 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TrhQ62361 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TrhQ62361 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TrhQ62361 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TrhQ62361 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TrhQ62361 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TrhQ62361 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TrhQ62361 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TrhQ62361 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TrhQ62361 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TrhQ62361 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TrhQ62361 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TrhQ62361 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TrhQ62361 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TrhQ62361 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TrhQ62361 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TrhQ62361 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TrhQ62361 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TrhQ62361 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TrhQ62361 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TrhQ62361 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TrhQ62361 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TrhQ62361 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TrhQ62361 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TrhQ62361 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TrhQ62361 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TrhQ62361 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TrhQ62361 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TrhQ62361 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TrhQ62361 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TrhQ62361 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TrhQ62361 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TrhQ62361 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TrhQ62361 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TrhQ62361 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TrhQ62361 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TrhQ62361 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TrhQ62361 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TrhQ62361 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TrhQ62361 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TrhQ62361 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TrhQ62361 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TrhQ62361 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TrhQ62361 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TrhQ62361 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TrhQ62361 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TrhQ62361 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms