Protein–RNA interactions for Protein: Q62288

Spock1, Testican-1, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spock1Q62288 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spock1Q62288 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spock1Q62288 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Spock1Q62288 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spock1Q62288 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spock1Q62288 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Spock1Q62288 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spock1Q62288 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spock1Q62288 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spock1Q62288 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spock1Q62288 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spock1Q62288 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spock1Q62288 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spock1Q62288 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spock1Q62288 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spock1Q62288 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spock1Q62288 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spock1Q62288 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spock1Q62288 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spock1Q62288 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spock1Q62288 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spock1Q62288 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spock1Q62288 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spock1Q62288 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spock1Q62288 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spock1Q62288 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spock1Q62288 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spock1Q62288 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spock1Q62288 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spock1Q62288 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Spock1Q62288 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spock1Q62288 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spock1Q62288 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spock1Q62288 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Spock1Q62288 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spock1Q62288 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spock1Q62288 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Spock1Q62288 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spock1Q62288 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spock1Q62288 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spock1Q62288 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spock1Q62288 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spock1Q62288 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spock1Q62288 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Spock1Q62288 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spock1Q62288 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spock1Q62288 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spock1Q62288 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spock1Q62288 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spock1Q62288 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spock1Q62288 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spock1Q62288 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Spock1Q62288 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Spock1Q62288 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spock1Q62288 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spock1Q62288 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spock1Q62288 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spock1Q62288 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spock1Q62288 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spock1Q62288 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spock1Q62288 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spock1Q62288 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spock1Q62288 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spock1Q62288 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spock1Q62288 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spock1Q62288 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Spock1Q62288 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Spock1Q62288 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spock1Q62288 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spock1Q62288 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spock1Q62288 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Spock1Q62288 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spock1Q62288 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spock1Q62288 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spock1Q62288 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spock1Q62288 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spock1Q62288 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Spock1Q62288 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spock1Q62288 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spock1Q62288 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spock1Q62288 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spock1Q62288 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spock1Q62288 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spock1Q62288 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spock1Q62288 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spock1Q62288 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Spock1Q62288 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spock1Q62288 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spock1Q62288 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spock1Q62288 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spock1Q62288 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spock1Q62288 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spock1Q62288 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spock1Q62288 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spock1Q62288 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spock1Q62288 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spock1Q62288 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spock1Q62288 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spock1Q62288 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Spock1Q62288 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms