Protein–RNA interactions for Protein: Q62277

Syp, Synaptophysin, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SypQ62277 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SypQ62277 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SypQ62277 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SypQ62277 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SypQ62277 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SypQ62277 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SypQ62277 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SypQ62277 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SypQ62277 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SypQ62277 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SypQ62277 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SypQ62277 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SypQ62277 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SypQ62277 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SypQ62277 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SypQ62277 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SypQ62277 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SypQ62277 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SypQ62277 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SypQ62277 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SypQ62277 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SypQ62277 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SypQ62277 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SypQ62277 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SypQ62277 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SypQ62277 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SypQ62277 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SypQ62277 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SypQ62277 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SypQ62277 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SypQ62277 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SypQ62277 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SypQ62277 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SypQ62277 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SypQ62277 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SypQ62277 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SypQ62277 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SypQ62277 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SypQ62277 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SypQ62277 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SypQ62277 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SypQ62277 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SypQ62277 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SypQ62277 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SypQ62277 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SypQ62277 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SypQ62277 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SypQ62277 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SypQ62277 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SypQ62277 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SypQ62277 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SypQ62277 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SypQ62277 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SypQ62277 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SypQ62277 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SypQ62277 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SypQ62277 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SypQ62277 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SypQ62277 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SypQ62277 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SypQ62277 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SypQ62277 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SypQ62277 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SypQ62277 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SypQ62277 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SypQ62277 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SypQ62277 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SypQ62277 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SypQ62277 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SypQ62277 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SypQ62277 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SypQ62277 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SypQ62277 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SypQ62277 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SypQ62277 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SypQ62277 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SypQ62277 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SypQ62277 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SypQ62277 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SypQ62277 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SypQ62277 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SypQ62277 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SypQ62277 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SypQ62277 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SypQ62277 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SypQ62277 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SypQ62277 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SypQ62277 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SypQ62277 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SypQ62277 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SypQ62277 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SypQ62277 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SypQ62277 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SypQ62277 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SypQ62277 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SypQ62277 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SypQ62277 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SypQ62277 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SypQ62277 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SypQ62277 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms