Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sall3Q62255 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sall3Q62255 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Sall3Q62255 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Sall3Q62255 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Sall3Q62255 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Sall3Q62255 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Sall3Q62255 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Sall3Q62255 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Sall3Q62255 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Sall3Q62255 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Sall3Q62255 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sall3Q62255 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sall3Q62255 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sall3Q62255 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sall3Q62255 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sall3Q62255 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sall3Q62255 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Sall3Q62255 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Sall3Q62255 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Sall3Q62255 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Sall3Q62255 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Sall3Q62255 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Sall3Q62255 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Sall3Q62255 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Sall3Q62255 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Sall3Q62255 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Sall3Q62255 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Sall3Q62255 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Sall3Q62255 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Sall3Q62255 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Sall3Q62255 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Sall3Q62255 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Sall3Q62255 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Sall3Q62255 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Sall3Q62255 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sall3Q62255 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sall3Q62255 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Sall3Q62255 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Sall3Q62255 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sall3Q62255 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Sall3Q62255 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sall3Q62255 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sall3Q62255 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sall3Q62255 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sall3Q62255 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sall3Q62255 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Sall3Q62255 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Sall3Q62255 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sall3Q62255 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sall3Q62255 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sall3Q62255 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sall3Q62255 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sall3Q62255 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sall3Q62255 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sall3Q62255 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sall3Q62255 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sall3Q62255 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sall3Q62255 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sall3Q62255 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sall3Q62255 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sall3Q62255 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sall3Q62255 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sall3Q62255 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sall3Q62255 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sall3Q62255 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sall3Q62255 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sall3Q62255 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sall3Q62255 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sall3Q62255 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sall3Q62255 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sall3Q62255 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sall3Q62255 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sall3Q62255 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sall3Q62255 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sall3Q62255 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sall3Q62255 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sall3Q62255 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Sall3Q62255 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Sall3Q62255 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Sall3Q62255 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sall3Q62255 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Sall3Q62255 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sall3Q62255 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sall3Q62255 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sall3Q62255 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sall3Q62255 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sall3Q62255 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sall3Q62255 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sall3Q62255 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sall3Q62255 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sall3Q62255 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sall3Q62255 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sall3Q62255 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sall3Q62255 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sall3Q62255 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sall3Q62255 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sall3Q62255 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sall3Q62255 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sall3Q62255 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms