Protein–RNA interactions for Protein: Q62241

Snrpc, U1 small nuclear ribonucleoprotein C, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpcQ62241 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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SnrpcQ62241 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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SnrpcQ62241 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SnrpcQ62241 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SnrpcQ62241 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SnrpcQ62241 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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SnrpcQ62241 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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SnrpcQ62241 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SnrpcQ62241 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SnrpcQ62241 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SnrpcQ62241 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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SnrpcQ62241 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SnrpcQ62241 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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SnrpcQ62241 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SnrpcQ62241 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SnrpcQ62241 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SnrpcQ62241 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SnrpcQ62241 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SnrpcQ62241 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SnrpcQ62241 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SnrpcQ62241 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SnrpcQ62241 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SnrpcQ62241 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SnrpcQ62241 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SnrpcQ62241 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SnrpcQ62241 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SnrpcQ62241 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SnrpcQ62241 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SnrpcQ62241 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SnrpcQ62241 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SnrpcQ62241 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SnrpcQ62241 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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