Protein–RNA interactions for Protein: Q62232

Six2, Homeobox protein SIX2, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six2Q62232 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Six2Q62232 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Six2Q62232 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Six2Q62232 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Six2Q62232 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Six2Q62232 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Six2Q62232 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Six2Q62232 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Six2Q62232 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Six2Q62232 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Six2Q62232 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Six2Q62232 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Six2Q62232 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Six2Q62232 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Six2Q62232 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Six2Q62232 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Six2Q62232 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Six2Q62232 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Six2Q62232 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Six2Q62232 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Six2Q62232 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Six2Q62232 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Six2Q62232 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Six2Q62232 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Six2Q62232 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Six2Q62232 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Six2Q62232 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Six2Q62232 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Six2Q62232 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Six2Q62232 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Six2Q62232 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Six2Q62232 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Six2Q62232 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Six2Q62232 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Six2Q62232 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Six2Q62232 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Six2Q62232 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Six2Q62232 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Six2Q62232 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Six2Q62232 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Six2Q62232 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Six2Q62232 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Six2Q62232 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Six2Q62232 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Six2Q62232 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Six2Q62232 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Six2Q62232 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Six2Q62232 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Six2Q62232 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Six2Q62232 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Six2Q62232 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Six2Q62232 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Six2Q62232 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Six2Q62232 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Six2Q62232 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Six2Q62232 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Six2Q62232 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Six2Q62232 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Six2Q62232 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Six2Q62232 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Six2Q62232 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Six2Q62232 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Six2Q62232 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Six2Q62232 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Six2Q62232 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Six2Q62232 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Six2Q62232 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Six2Q62232 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Six2Q62232 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Six2Q62232 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Six2Q62232 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Six2Q62232 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Six2Q62232 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Six2Q62232 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Six2Q62232 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Six2Q62232 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Six2Q62232 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Six2Q62232 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Six2Q62232 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Six2Q62232 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Six2Q62232 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Six2Q62232 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Six2Q62232 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Six2Q62232 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Six2Q62232 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Six2Q62232 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Six2Q62232 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Six2Q62232 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Six2Q62232 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Six2Q62232 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Six2Q62232 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Six2Q62232 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Six2Q62232 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Six2Q62232 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Six2Q62232 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Six2Q62232 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Six2Q62232 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Six2Q62232 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Six2Q62232 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Six2Q62232 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms