Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sycp1Q62209 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sycp1Q62209 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sycp1Q62209 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sycp1Q62209 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sycp1Q62209 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sycp1Q62209 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sycp1Q62209 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sycp1Q62209 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sycp1Q62209 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sycp1Q62209 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sycp1Q62209 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sycp1Q62209 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sycp1Q62209 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Sycp1Q62209 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Sycp1Q62209 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sycp1Q62209 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sycp1Q62209 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sycp1Q62209 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sycp1Q62209 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sycp1Q62209 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sycp1Q62209 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sycp1Q62209 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sycp1Q62209 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sycp1Q62209 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Sycp1Q62209 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sycp1Q62209 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Sycp1Q62209 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sycp1Q62209 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sycp1Q62209 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sycp1Q62209 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sycp1Q62209 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sycp1Q62209 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Sycp1Q62209 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sycp1Q62209 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sycp1Q62209 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sycp1Q62209 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Sycp1Q62209 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sycp1Q62209 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sycp1Q62209 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Sycp1Q62209 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Sycp1Q62209 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Sycp1Q62209 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sycp1Q62209 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Sycp1Q62209 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Sycp1Q62209 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sycp1Q62209 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Sycp1Q62209 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sycp1Q62209 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sycp1Q62209 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sycp1Q62209 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sycp1Q62209 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sycp1Q62209 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Sycp1Q62209 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Sycp1Q62209 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sycp1Q62209 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sycp1Q62209 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sycp1Q62209 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sycp1Q62209 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sycp1Q62209 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sycp1Q62209 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sycp1Q62209 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sycp1Q62209 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sycp1Q62209 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sycp1Q62209 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sycp1Q62209 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sycp1Q62209 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Sycp1Q62209 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Sycp1Q62209 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Sycp1Q62209 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sycp1Q62209 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sycp1Q62209 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sycp1Q62209 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sycp1Q62209 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sycp1Q62209 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sycp1Q62209 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sycp1Q62209 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sycp1Q62209 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sycp1Q62209 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sycp1Q62209 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sycp1Q62209 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sycp1Q62209 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sycp1Q62209 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sycp1Q62209 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sycp1Q62209 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sycp1Q62209 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sycp1Q62209 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sycp1Q62209 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sycp1Q62209 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sycp1Q62209 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sycp1Q62209 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sycp1Q62209 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sycp1Q62209 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sycp1Q62209 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sycp1Q62209 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sycp1Q62209 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sycp1Q62209 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Sycp1Q62209 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sycp1Q62209 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sycp1Q62209 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms